123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1337 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  100 
 
 		 491 aa  1009    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  48.35 
 
 		 529 aa  392  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  44.4 
 
 		 498 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  41.79 
 
 		 503 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  35.23 
 
 		 528 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  35.79 
 
 		 535 aa  246  6e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.82 
 
 		 534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.96 
 
 		 534 aa  234  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.19 
 
 		 535 aa  232  9e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  33.62 
 
 		 849 aa  219  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  32.98 
 
 		 521 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  31.2 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  30.17 
 
 		 558 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  29.5 
 
 		 602 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  30.84 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  30.17 
 
 		 581 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  29.74 
 
 		 581 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  30.47 
 
 		 540 aa  181  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  30.82 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  30.88 
 
 		 537 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.66 
 
 		 541 aa  179  1e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  28.66 
 
 		 543 aa  178  2e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  31.46 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  31.01 
 
 		 550 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  29.41 
 
 		 557 aa  172  7.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.97 
 
 		 586 aa  172  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.25 
 
 		 581 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  28.54 
 
 		 542 aa  169  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  29.7 
 
 		 540 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  28.75 
 
 		 542 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  30 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  26.16 
 
 		 565 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  28.9 
 
 		 566 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  28.42 
 
 		 552 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.24 
 
 		 562 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.24 
 
 		 562 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.86 
 
 		 555 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  29.57 
 
 		 535 aa  156  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.18 
 
 		 510 aa  156  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  28.46 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  26.44 
 
 		 588 aa  155  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  26.75 
 
 		 562 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  26.75 
 
 		 562 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  27.29 
 
 		 545 aa  152  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  28.18 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  28.18 
 
 		 606 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  27.16 
 
 		 561 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  26.75 
 
 		 562 aa  150  7e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  27 
 
 		 564 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.83 
 
 		 561 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  28.63 
 
 		 580 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  26.54 
 
 		 564 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  27.16 
 
 		 604 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  26.32 
 
 		 553 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.61 
 
 		 593 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  26 
 
 		 602 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.41 
 
 		 611 aa  137  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  25.93 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  34.98 
 
 		 229 aa  134  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  26.71 
 
 		 579 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  26.52 
 
 		 561 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  26.52 
 
 		 569 aa  133  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.27 
 
 		 571 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  26.38 
 
 		 565 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.58 
 
 		 546 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  25.81 
 
 		 574 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.1 
 
 		 585 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  26.71 
 
 		 581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  26.62 
 
 		 574 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  25.88 
 
 		 581 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  25.77 
 
 		 581 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  26.21 
 
 		 573 aa  116  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  24.84 
 
 		 572 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  24.15 
 
 		 568 aa  114  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25.35 
 
 		 565 aa  113  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  26.15 
 
 		 591 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  24.7 
 
 		 590 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  24.7 
 
 		 590 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  24.7 
 
 		 590 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.89 
 
 		 590 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.89 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.43 
 
 		 577 aa  107  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  23.74 
 
 		 577 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.1 
 
 		 569 aa  103  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  25.28 
 
 		 356 aa  103  9e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  28.39 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  25.53 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  25.53 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.01 
 
 		 629 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  27.59 
 
 		 169 aa  94.4  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.25 
 
 		 489 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  25.43 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  25.43 
 
 		 489 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  27.41 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  21.26 
 
 		 584 aa  87  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  27.07 
 
 		 544 aa  84.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  23.53 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  26.42 
 
 		 551 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.24 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  23.75 
 
 		 569 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>