104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0563 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  100 
 
 		 584 aa  1224    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  29.14 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  29.89 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  28.79 
 
 		 585 aa  202  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  26.77 
 
 		 564 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  28.2 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  29.09 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  28.6 
 
 		 564 aa  184  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  25.98 
 
 		 556 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  30.69 
 
 		 849 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.09 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  29.12 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  29.12 
 
 		 534 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  27.7 
 
 		 535 aa  172  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  28.46 
 
 		 557 aa  171  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  26.54 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  26.38 
 
 		 552 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  25.54 
 
 		 577 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  28.54 
 
 		 562 aa  160  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  27.31 
 
 		 553 aa  160  4e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  28.63 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  28.63 
 
 		 562 aa  160  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.04 
 
 		 571 aa  160  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  28.28 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  26 
 
 		 572 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  25.52 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25.17 
 
 		 565 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.75 
 
 		 546 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  25.83 
 
 		 583 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  24.77 
 
 		 581 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.85 
 
 		 561 aa  154  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.82 
 
 		 577 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  24.1 
 
 		 590 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  24.1 
 
 		 590 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  24.1 
 
 		 590 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  26.44 
 
 		 579 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  23.92 
 
 		 573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  24.63 
 
 		 561 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  26.72 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  26.72 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  24.42 
 
 		 569 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  24.77 
 
 		 581 aa  148  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.76 
 
 		 556 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.33 
 
 		 586 aa  146  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  26.13 
 
 		 543 aa  144  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  25.53 
 
 		 541 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  24.72 
 
 		 558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  24.87 
 
 		 581 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  23.77 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  25.75 
 
 		 581 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  24.66 
 
 		 574 aa  133  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  27.78 
 
 		 530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  25.05 
 
 		 602 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.03 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  27.69 
 
 		 588 aa  127  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.81 
 
 		 510 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  24.53 
 
 		 550 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.74 
 
 		 542 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.68 
 
 		 546 aa  124  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  25.54 
 
 		 537 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  22.59 
 
 		 581 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.19 
 
 		 545 aa  120  9e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  25.45 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.3 
 
 		 591 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  25.68 
 
 		 542 aa  118  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.35 
 
 		 590 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.35 
 
 		 562 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.6 
 
 		 602 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  25.95 
 
 		 455 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  24.5 
 
 		 563 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  24.5 
 
 		 563 aa  110  1e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.05 
 
 		 535 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  28.89 
 
 		 561 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  24.48 
 
 		 535 aa  98.6  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  28.32 
 
 		 356 aa  97.1  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  23.92 
 
 		 604 aa  97.1  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.83 
 
 		 529 aa  96.7  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  24.53 
 
 		 540 aa  95.9  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  25.06 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  23.85 
 
 		 580 aa  92  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.96 
 
 		 503 aa  90.5  7e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.9 
 
 		 528 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  21.1 
 
 		 629 aa  89  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  22.59 
 
 		 555 aa  87.8  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  21.26 
 
 		 491 aa  87  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  21.79 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.14 
 
 		 569 aa  83.2  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  29.49 
 
 		 229 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.5 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  29.33 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  21.93 
 
 		 489 aa  63.9  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  29.32 
 
 		 169 aa  62  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  37.21 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  22.83 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  21.97 
 
 		 611 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  20.56 
 
 		 489 aa  55.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.5 
 
 		 606 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.76 
 
 		 606 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.59 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  21.81 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0389174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>