97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2689 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  100 
 
 
629 aa  1305    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  30.34 
 
 
564 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  28.93 
 
 
574 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.38 
 
 
577 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  28.11 
 
 
577 aa  208  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.99 
 
 
586 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  25.55 
 
 
573 aa  201  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  29.6 
 
 
565 aa  201  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  26.77 
 
 
581 aa  176  9e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  25.81 
 
 
556 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  28.52 
 
 
568 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  26.52 
 
 
561 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  27.09 
 
 
581 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  26.19 
 
 
569 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  24.53 
 
 
553 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  28.54 
 
 
455 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  26.82 
 
 
849 aa  154  5.9999999999999996e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  23.72 
 
 
590 aa  153  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  23.72 
 
 
590 aa  153  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  23.72 
 
 
590 aa  153  8e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  25.04 
 
 
585 aa  152  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  25.87 
 
 
566 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  26.14 
 
 
557 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  24.07 
 
 
564 aa  150  8e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  25.38 
 
 
534 aa  146  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  25.33 
 
 
535 aa  146  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  25.38 
 
 
534 aa  146  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  26 
 
 
535 aa  145  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.49 
 
 
569 aa  143  7e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  23.88 
 
 
541 aa  140  7e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  24.58 
 
 
552 aa  140  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  24.51 
 
 
530 aa  137  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  26.75 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  23.98 
 
 
565 aa  135  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  26.75 
 
 
537 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.78 
 
 
521 aa  133  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.97 
 
 
535 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.34 
 
 
535 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  23.03 
 
 
581 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  24.5 
 
 
583 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  23.86 
 
 
565 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.93 
 
 
574 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  21.51 
 
 
543 aa  118  3.9999999999999997e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  22.3 
 
 
581 aa  117  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.35 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  24.28 
 
 
579 aa  111  5e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  23.6 
 
 
542 aa  109  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  21.77 
 
 
558 aa  109  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.6 
 
 
542 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.77 
 
 
546 aa  107  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  22.57 
 
 
540 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  23.24 
 
 
510 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  22.58 
 
 
571 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  23.01 
 
 
491 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  21.04 
 
 
572 aa  101  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  21.53 
 
 
581 aa  100  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  23.66 
 
 
561 aa  100  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  22.55 
 
 
602 aa  99.4  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.49 
 
 
540 aa  98.6  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  25.17 
 
 
556 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  20.98 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  20.98 
 
 
563 aa  92.4  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  23.75 
 
 
581 aa  92  3e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  22.91 
 
 
580 aa  89  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  21.1 
 
 
584 aa  89  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  21.84 
 
 
546 aa  86.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  21.28 
 
 
550 aa  83.2  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  22.13 
 
 
602 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  21.8 
 
 
604 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  21.97 
 
 
555 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  26.43 
 
 
229 aa  75.5  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  21.34 
 
 
561 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  18.97 
 
 
591 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  21.08 
 
 
588 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  24.58 
 
 
498 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  19.44 
 
 
555 aa  70.5  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.56 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.56 
 
 
562 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.08 
 
 
562 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  21.88 
 
 
553 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  19.21 
 
 
555 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  20 
 
 
555 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  21.88 
 
 
553 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  18.91 
 
 
590 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  18.79 
 
 
562 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  28.12 
 
 
169 aa  68.6  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  20.63 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  20.63 
 
 
562 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  19.95 
 
 
551 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  21.21 
 
 
503 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.22 
 
 
529 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  19.95 
 
 
528 aa  56.6  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  20.11 
 
 
558 aa  56.2  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  22.65 
 
 
356 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  31.72 
 
 
163 aa  50.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  24.34 
 
 
629 aa  45.4  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  22.97 
 
 
611 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>