134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0397 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  83.46 
 
 
535 aa  937    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 
534 aa  1113    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  78.22 
 
 
849 aa  745    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  81.27 
 
 
535 aa  898    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  99.63 
 
 
534 aa  1110    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  51.05 
 
 
521 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  78.26 
 
 
229 aa  382  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  37.28 
 
 
557 aa  337  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  36.73 
 
 
581 aa  318  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  35.94 
 
 
530 aa  305  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  36.65 
 
 
565 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  35.98 
 
 
546 aa  301  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  36.59 
 
 
558 aa  299  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  33.58 
 
 
580 aa  298  2e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  35.07 
 
 
564 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  35.44 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  35.44 
 
 
562 aa  295  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  34.85 
 
 
602 aa  292  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  34.09 
 
 
585 aa  290  4e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  35.38 
 
 
574 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  34.91 
 
 
537 aa  287  4e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  33.21 
 
 
563 aa  287  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  32.94 
 
 
569 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  35.28 
 
 
581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  32.74 
 
 
561 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  35.87 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  33.77 
 
 
541 aa  284  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  34.72 
 
 
537 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  33.33 
 
 
543 aa  281  2e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  33.99 
 
 
562 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  33.99 
 
 
562 aa  278  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  33.4 
 
 
545 aa  278  2e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  33.67 
 
 
556 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  33.6 
 
 
562 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.13 
 
 
552 aa  276  9e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  32.79 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  33.33 
 
 
550 aa  273  8.000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  31.83 
 
 
590 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  31.83 
 
 
590 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  31.83 
 
 
590 aa  271  2e-71  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  33.93 
 
 
586 aa  270  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  34.24 
 
 
542 aa  268  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  34.44 
 
 
542 aa  268  2e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  35.28 
 
 
498 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  35.09 
 
 
561 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  32.81 
 
 
566 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  33.79 
 
 
565 aa  264  3e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  33.47 
 
 
561 aa  264  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  32.76 
 
 
568 aa  263  4e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  32.56 
 
 
581 aa  261  2e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  33.27 
 
 
577 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  32.54 
 
 
573 aa  258  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  32.05 
 
 
564 aa  258  3e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  34.27 
 
 
546 aa  256  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  33.2 
 
 
535 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  33.07 
 
 
535 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  32.48 
 
 
577 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  32.82 
 
 
529 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  31.53 
 
 
574 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  31.51 
 
 
510 aa  249  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  32.44 
 
 
565 aa  249  1e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  33.15 
 
 
540 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  33.82 
 
 
491 aa  243  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  32.26 
 
 
583 aa  241  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  32.12 
 
 
581 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  32.78 
 
 
540 aa  236  8e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  29.45 
 
 
588 aa  233  5e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  29.97 
 
 
602 aa  231  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  29.75 
 
 
572 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  31.58 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  30 
 
 
579 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  30.69 
 
 
555 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  30.39 
 
 
604 aa  213  5.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  30.18 
 
 
528 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.16 
 
 
590 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.16 
 
 
562 aa  210  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.16 
 
 
591 aa  210  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  28.27 
 
 
581 aa  204  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.94 
 
 
563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.94 
 
 
563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  28.25 
 
 
571 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  31.93 
 
 
455 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  29.12 
 
 
584 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  32.37 
 
 
356 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.82 
 
 
611 aa  160  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  27.09 
 
 
606 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  29.34 
 
 
556 aa  157  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.51 
 
 
606 aa  157  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  25.38 
 
 
629 aa  154  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  48.3 
 
 
169 aa  154  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.61 
 
 
569 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.59 
 
 
593 aa  141  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  25.84 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.43 
 
 
534 aa  117  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.51 
 
 
489 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  24.29 
 
 
558 aa  109  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  24.79 
 
 
569 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  24.38 
 
 
569 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  35.8 
 
 
215 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  22.67 
 
 
551 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>