130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1726 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  68.65 
 
 		 542 aa  788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  100 
 
 		 540 aa  1105    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  68.46 
 
 		 542 aa  785    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  66.35 
 
 		 540 aa  702    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  55.99 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  57.64 
 
 		 530 aa  595  1e-169  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  52.26 
 
 		 537 aa  533  1e-150  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  51.89 
 
 		 537 aa  531  1e-149  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  52.65 
 
 		 561 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  52.19 
 
 		 535 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  52 
 
 		 535 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  50.98 
 
 		 510 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.2 
 
 		 535 aa  257  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  34.48 
 
 		 521 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  33.07 
 
 		 535 aa  248  2e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.46 
 
 		 534 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.46 
 
 		 534 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.81 
 
 		 849 aa  223  6e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  31.07 
 
 		 557 aa  213  4.9999999999999996e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  30.68 
 
 		 528 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  30.87 
 
 		 491 aa  186  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  29.08 
 
 		 558 aa  179  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  28.66 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  26.03 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  26.03 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  26.03 
 
 		 590 aa  179  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.8 
 
 		 564 aa  178  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  27.64 
 
 		 543 aa  178  3e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  27.63 
 
 		 569 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  27.4 
 
 		 581 aa  175  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  26.48 
 
 		 541 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  30.27 
 
 		 529 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.09 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  30.72 
 
 		 503 aa  172  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  27.31 
 
 		 552 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  26.86 
 
 		 581 aa  170  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.86 
 
 		 585 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  26.29 
 
 		 581 aa  169  8e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.6 
 
 		 602 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  30.65 
 
 		 498 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  27.12 
 
 		 563 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.01 
 
 		 565 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  26.34 
 
 		 566 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  28.82 
 
 		 583 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  27.29 
 
 		 577 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  27.15 
 
 		 546 aa  157  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.58 
 
 		 580 aa  156  8e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  25.6 
 
 		 550 aa  152  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  27.49 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.74 
 
 		 565 aa  152  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.31 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.76 
 
 		 553 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.66 
 
 		 555 aa  150  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  27.2 
 
 		 574 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  25.58 
 
 		 568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  25.45 
 
 		 588 aa  147  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  23.97 
 
 		 579 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.85 
 
 		 591 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  24.8 
 
 		 573 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  25.1 
 
 		 564 aa  144  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.65 
 
 		 562 aa  143  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.65 
 
 		 590 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.4 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  26.48 
 
 		 581 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  26.57 
 
 		 604 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.61 
 
 		 593 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  25.7 
 
 		 611 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.57 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.81 
 
 		 546 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  23.97 
 
 		 572 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  23.47 
 
 		 563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  23.47 
 
 		 563 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  23.61 
 
 		 565 aa  127  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  25.73 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  23.58 
 
 		 574 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  32.43 
 
 		 229 aa  125  2e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  25.73 
 
 		 606 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  24.36 
 
 		 602 aa  125  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  21.54 
 
 		 571 aa  123  8e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  26.74 
 
 		 455 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  24.51 
 
 		 562 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  24.51 
 
 		 562 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.82 
 
 		 562 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.82 
 
 		 562 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.82 
 
 		 562 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  22.66 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  25 
 
 		 569 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  25 
 
 		 569 aa  103  7e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  23.87 
 
 		 556 aa  98.2  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.49 
 
 		 629 aa  97.8  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.82 
 
 		 569 aa  97.1  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.53 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  26.35 
 
 		 504 aa  88.2  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  25.76 
 
 		 573 aa  87.4  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  25.76 
 
 		 573 aa  87  9e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  23.03 
 
 		 557 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  28.05 
 
 		 551 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  25.76 
 
 		 544 aa  83.2  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  20.97 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  25.6 
 
 		 489 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>