109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2998 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  100 
 
 		 528 aa  1093    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  50.2 
 
 		 503 aa  483  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  46.41 
 
 		 498 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  42.66 
 
 		 529 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  35.23 
 
 		 491 aa  283  7.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  32.39 
 
 		 521 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  31.16 
 
 		 530 aa  219  7e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  29.94 
 
 		 535 aa  211  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  28.69 
 
 		 535 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  29.31 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  30.15 
 
 		 535 aa  207  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  29.22 
 
 		 545 aa  205  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  28.07 
 
 		 537 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  30.18 
 
 		 534 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  27.68 
 
 		 537 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  30.18 
 
 		 534 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  30.16 
 
 		 540 aa  194  3e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  27.08 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.45 
 
 		 558 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.27 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  28.94 
 
 		 849 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  27.64 
 
 		 581 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.77 
 
 		 542 aa  181  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  27.77 
 
 		 542 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  27.59 
 
 		 550 aa  179  9e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.25 
 
 		 602 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  28.63 
 
 		 540 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.13 
 
 		 510 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  26.98 
 
 		 563 aa  174  3.9999999999999995e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  28.36 
 
 		 552 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.09 
 
 		 561 aa  172  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  27.07 
 
 		 557 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  27.35 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  27.89 
 
 		 543 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  26.26 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  27.27 
 
 		 546 aa  144  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  26.83 
 
 		 606 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.57 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  26.65 
 
 		 583 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  24.36 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.91 
 
 		 602 aa  137  5e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.08 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  26.18 
 
 		 588 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.34 
 
 		 586 aa  132  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  25.53 
 
 		 590 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  25.53 
 
 		 590 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  25.53 
 
 		 590 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.23 
 
 		 593 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  24.71 
 
 		 585 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  23.73 
 
 		 546 aa  127  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  33.65 
 
 		 229 aa  127  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  25.1 
 
 		 562 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  25.1 
 
 		 562 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.99 
 
 		 553 aa  124  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  25.54 
 
 		 504 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  25.27 
 
 		 574 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.02 
 
 		 561 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  23.71 
 
 		 580 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  24.45 
 
 		 563 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  24.45 
 
 		 563 aa  116  8.999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  24.81 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  24.32 
 
 		 544 aa  114  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  23.39 
 
 		 561 aa  113  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.39 
 
 		 569 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.68 
 
 		 577 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  23.87 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  26.07 
 
 		 604 aa  113  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  22.33 
 
 		 565 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  23.59 
 
 		 577 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.09 
 
 		 564 aa  110  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  24.64 
 
 		 568 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  25.05 
 
 		 551 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  22.72 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  22.72 
 
 		 562 aa  108  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.52 
 
 		 562 aa  106  9e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  21.37 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  25.05 
 
 		 565 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  22.76 
 
 		 574 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  25.25 
 
 		 566 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  22.02 
 
 		 556 aa  99  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  23.29 
 
 		 573 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  24.65 
 
 		 579 aa  97.1  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  23.53 
 
 		 564 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  35.03 
 
 		 169 aa  95.9  2e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  23.16 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.65 
 
 		 591 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.54 
 
 		 489 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.04 
 
 		 562 aa  90.1  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.04 
 
 		 590 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  23.9 
 
 		 584 aa  89.4  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.86 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  24.94 
 
 		 525 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  24.94 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.26 
 
 		 581 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  23.25 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  25.75 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  25.75 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  27.42 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  21.65 
 
 		 569 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  25.29 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>