55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0213 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  100 
 
 		 551 aa  1089    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  81.68 
 
 		 544 aa  856    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  73.27 
 
 		 504 aa  743    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  30.14 
 
 		 498 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  28.27 
 
 		 529 aa  118  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  25.24 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.5 
 
 		 558 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.02 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  26.1 
 
 		 581 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  27.6 
 
 		 530 aa  93.2  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.64 
 
 		 535 aa  92  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  29.04 
 
 		 540 aa  87.4  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  28.05 
 
 		 540 aa  84.7  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  27.05 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  25.05 
 
 		 550 aa  84  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.99 
 
 		 491 aa  83.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.82 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.71 
 
 		 537 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  25.62 
 
 		 581 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.09 
 
 		 535 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.11 
 
 		 542 aa  80.1  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.64 
 
 		 561 aa  77.8  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.82 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  24.33 
 
 		 537 aa  75.9  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.61 
 
 		 541 aa  73.6  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  22.32 
 
 		 557 aa  71.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.06 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.1 
 
 		 569 aa  70.5  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.41 
 
 		 510 aa  70.5  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  26.45 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  25.37 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  24.13 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  23.95 
 
 		 565 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  22.14 
 
 		 535 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  23.17 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.1 
 
 		 543 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  23.17 
 
 		 534 aa  60.5  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  22.82 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  24.28 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  24.06 
 
 		 606 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  21.26 
 
 		 535 aa  54.3  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.69 
 
 		 566 aa  52.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  20.44 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  22.98 
 
 		 849 aa  52.4  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  22.25 
 
 		 579 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  23.94 
 
 		 557 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  32.08 
 
 		 163 aa  47.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  25.14 
 
 		 583 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  23.53 
 
 		 604 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  21.24 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  22.61 
 
 		 611 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  23.53 
 
 		 229 aa  44.3  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  22.4 
 
 		 564 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  24.87 
 
 		 566 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4204  hypothetical protein  32.68 
 
 		 394 aa  43.5  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.460472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>