128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1335 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  98.57 
 
 		 561 aa  1148    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  100 
 
 		 569 aa  1179    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  51.11 
 
 		 564 aa  561  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  51.25 
 
 		 581 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  48 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  46.15 
 
 		 577 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  46.15 
 
 		 577 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  46.76 
 
 		 574 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  42.29 
 
 		 573 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  41.98 
 
 		 581 aa  427  1e-118  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  43.19 
 
 		 565 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  36.77 
 
 		 585 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  32.08 
 
 		 590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  32.08 
 
 		 590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  32.08 
 
 		 590 aa  310  2.9999999999999997e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  34.89 
 
 		 521 aa  302  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  33.95 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  34.53 
 
 		 568 aa  291  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.98 
 
 		 557 aa  288  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  32.77 
 
 		 564 aa  287  4e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  32.96 
 
 		 565 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  32.7 
 
 		 586 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  32.94 
 
 		 534 aa  277  4e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  32.94 
 
 		 534 aa  276  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  31.86 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  32.55 
 
 		 535 aa  268  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  32.61 
 
 		 535 aa  266  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  39.2 
 
 		 455 aa  261  2e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.68 
 
 		 849 aa  256  6e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  31.4 
 
 		 553 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.9 
 
 		 541 aa  250  4e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  29.74 
 
 		 565 aa  236  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.57 
 
 		 591 aa  236  9e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.57 
 
 		 590 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.57 
 
 		 562 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  27.93 
 
 		 543 aa  233  8.000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  29.42 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  30.62 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  28.87 
 
 		 581 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  30.73 
 
 		 561 aa  226  6e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  29.26 
 
 		 572 aa  225  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.19 
 
 		 581 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  28.35 
 
 		 581 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.24 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.24 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  29.52 
 
 		 562 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.6 
 
 		 602 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  30.36 
 
 		 562 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  30.36 
 
 		 562 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.86 
 
 		 558 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  29.06 
 
 		 563 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  29.06 
 
 		 563 aa  216  7e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  29.8 
 
 		 580 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  29.68 
 
 		 546 aa  216  8e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.38 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  28.07 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  28.73 
 
 		 550 aa  205  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.77 
 
 		 579 aa  201  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.47 
 
 		 540 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  27.2 
 
 		 537 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.37 
 
 		 542 aa  179  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.83 
 
 		 569 aa  178  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  26.67 
 
 		 537 aa  178  3e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  27.57 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  27.67 
 
 		 583 aa  174  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.74 
 
 		 542 aa  172  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.97 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.67 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.17 
 
 		 546 aa  167  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  26.19 
 
 		 629 aa  167  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.61 
 
 		 588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.24 
 
 		 556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.51 
 
 		 535 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.1 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.77 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  24.65 
 
 		 604 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.34 
 
 		 602 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.42 
 
 		 584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.69 
 
 		 510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.32 
 
 		 555 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  26.58 
 
 		 498 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  26.57 
 
 		 503 aa  136  8e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.28 
 
 		 593 aa  135  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  24.01 
 
 		 529 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.52 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  32.52 
 
 		 229 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  45.45 
 
 		 163 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  36.41 
 
 		 215 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.3 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.39 
 
 		 528 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  23.06 
 
 		 629 aa  111  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1652  hypothetical protein  53.85 
 
 		 92 aa  109  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  22.92 
 
 		 570 aa  107  7e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.29 
 
 		 606 aa  104  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.12 
 
 		 606 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.14 
 
 		 611 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  21.89 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  26.49 
 
 		 569 aa  95.9  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  30.67 
 
 		 169 aa  94.7  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  25.91 
 
 		 569 aa  92.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>