107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2070 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  100 
 
 		 569 aa  1156    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  59.04 
 
 		 573 aa  665    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  59.22 
 
 		 573 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  98.24 
 
 		 569 aa  1139    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  52.82 
 
 		 570 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  52.8 
 
 		 566 aa  509  1e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  45.21 
 
 		 557 aa  499  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  44.29 
 
 		 562 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  44.86 
 
 		 570 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  43.61 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  41.67 
 
 		 573 aa  430  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  43.21 
 
 		 580 aa  428  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  43.4 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  41.07 
 
 		 566 aa  419  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  41.53 
 
 		 552 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  41.07 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  42.34 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  42.34 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  42.34 
 
 		 553 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  42.15 
 
 		 553 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.59 
 
 		 545 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.83 
 
 		 540 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.75 
 
 		 561 aa  116  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  25.86 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.1 
 
 		 530 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.45 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  26 
 
 		 577 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.56 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  24.9 
 
 		 581 aa  104  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.85 
 
 		 542 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  25.25 
 
 		 577 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.03 
 
 		 565 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25 
 
 		 540 aa  103  8e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  23.86 
 
 		 543 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  26.53 
 
 		 550 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.66 
 
 		 521 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  23.98 
 
 		 580 aa  100  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  24.38 
 
 		 534 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  24.38 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  24.55 
 
 		 546 aa  97.1  7e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  24.49 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  26.1 
 
 		 561 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  23.14 
 
 		 541 aa  95.9  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.48 
 
 		 561 aa  94.4  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  24.45 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  24.45 
 
 		 562 aa  93.2  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  25.91 
 
 		 569 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.77 
 
 		 562 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.77 
 
 		 562 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  22.94 
 
 		 573 aa  87.4  6e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  20.81 
 
 		 572 aa  87  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  23.27 
 
 		 553 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  23.8 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  23.71 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.13 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.99 
 
 		 562 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.02 
 
 		 565 aa  83.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  24.81 
 
 		 529 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  23.16 
 
 		 849 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  23.53 
 
 		 491 aa  80.5  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  24.64 
 
 		 602 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  22.55 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  22.55 
 
 		 563 aa  77.8  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  23.19 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.2 
 
 		 535 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  21.54 
 
 		 581 aa  77  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  20.58 
 
 		 562 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  20.58 
 
 		 590 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  23.14 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.53 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.81 
 
 		 566 aa  73.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.84 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  22.24 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  20.97 
 
 		 591 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  22.24 
 
 		 552 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  23.66 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.4 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  21.79 
 
 		 571 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  22.63 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  22.97 
 
 		 537 aa  69.7  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  22.99 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  21.21 
 
 		 528 aa  67  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  23.18 
 
 		 535 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  22.31 
 
 		 581 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  23.31 
 
 		 581 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  22.95 
 
 		 581 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.3 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  19.19 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  23.42 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  19.19 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  19.19 
 
 		 590 aa  58.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.39 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  21.72 
 
 		 604 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  22.48 
 
 		 546 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  24.18 
 
 		 356 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  22.87 
 
 		 563 aa  56.2  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  21.97 
 
 		 581 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  27.08 
 
 		 504 aa  53.9  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  20.79 
 
 		 606 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  20.98 
 
 		 606 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>