109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3315 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  98.24 
 
 		 569 aa  1139    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  59.4 
 
 		 573 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  59.57 
 
 		 573 aa  672    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  100 
 
 		 569 aa  1158    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  52.64 
 
 		 570 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  52.26 
 
 		 566 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  45.21 
 
 		 557 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  44.46 
 
 		 562 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  45.21 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  44.23 
 
 		 578 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  43.58 
 
 		 555 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  41.67 
 
 		 573 aa  432  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  43.21 
 
 		 580 aa  427  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  41.71 
 
 		 552 aa  418  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  41.25 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  41.25 
 
 		 566 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  42.34 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  42.34 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  42.34 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  42.15 
 
 		 553 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.49 
 
 		 545 aa  131  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.36 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  26.82 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.64 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  25.29 
 
 		 581 aa  105  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.05 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.97 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25 
 
 		 540 aa  104  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  26.2 
 
 		 577 aa  104  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  26.73 
 
 		 565 aa  103  6e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  24.7 
 
 		 530 aa  103  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  25 
 
 		 577 aa  103  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  24.19 
 
 		 580 aa  103  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.65 
 
 		 542 aa  100  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  23.66 
 
 		 543 aa  100  7e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  26.43 
 
 		 550 aa  99.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  26.68 
 
 		 561 aa  99  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.32 
 
 		 521 aa  97.8  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  24.79 
 
 		 534 aa  97.8  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  24.79 
 
 		 534 aa  96.7  9e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  26.49 
 
 		 569 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  24.69 
 
 		 535 aa  95.5  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.94 
 
 		 541 aa  95.1  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  24.75 
 
 		 546 aa  93.6  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  23.68 
 
 		 561 aa  91.7  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  24.5 
 
 		 562 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  24.5 
 
 		 562 aa  91.3  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  24.14 
 
 		 573 aa  89.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  23.65 
 
 		 553 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.41 
 
 		 565 aa  87  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  24.3 
 
 		 558 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.13 
 
 		 574 aa  84  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  20.84 
 
 		 572 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.41 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.41 
 
 		 562 aa  82  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  22.94 
 
 		 849 aa  81.6  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  23.06 
 
 		 556 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25 
 
 		 529 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.59 
 
 		 535 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  23.75 
 
 		 491 aa  78.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.59 
 
 		 562 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  22.33 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  22.33 
 
 		 563 aa  78.2  0.0000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  24.45 
 
 		 602 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  23.49 
 
 		 535 aa  77  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.8 
 
 		 455 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  23.33 
 
 		 557 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  20.78 
 
 		 590 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  20.78 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  22.07 
 
 		 581 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.69 
 
 		 564 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  22.56 
 
 		 566 aa  72.8  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  22.37 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  21.17 
 
 		 591 aa  71.2  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  24.44 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  23.71 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.53 
 
 		 503 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  22.97 
 
 		 537 aa  68.9  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  23.38 
 
 		 535 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  23.18 
 
 		 537 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  21.65 
 
 		 528 aa  68.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  21.81 
 
 		 571 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  23.62 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  23.06 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  23.06 
 
 		 581 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  23.29 
 
 		 581 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  19.8 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  19.8 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  19.8 
 
 		 590 aa  62.4  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  23.36 
 
 		 586 aa  61.6  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.8 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.67 
 
 		 611 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  20.15 
 
 		 555 aa  57.4  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  22.59 
 
 		 581 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  23.26 
 
 		 563 aa  54.7  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  22.48 
 
 		 546 aa  53.9  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  23.64 
 
 		 356 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  21.17 
 
 		 606 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  21.36 
 
 		 606 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  22.11 
 
 		 604 aa  53.5  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>