135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0867 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  84.79 
 
 		 541 aa  955    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 		 543 aa  1117    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  37.83 
 
 		 521 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  33.96 
 
 		 535 aa  278  1e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.33 
 
 		 534 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  32.5 
 
 		 557 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.15 
 
 		 534 aa  269  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  32.65 
 
 		 535 aa  263  4.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  32.16 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  34.19 
 
 		 849 aa  253  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.26 
 
 		 581 aa  252  1e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  31.08 
 
 		 590 aa  250  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  31.08 
 
 		 590 aa  250  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  31.08 
 
 		 590 aa  250  5e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  29.42 
 
 		 585 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.37 
 
 		 552 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  31.77 
 
 		 565 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  28.82 
 
 		 553 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  28.12 
 
 		 561 aa  236  8e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  31.64 
 
 		 565 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  31.93 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  31.93 
 
 		 562 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  32.02 
 
 		 566 aa  233  5e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  27.93 
 
 		 569 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  32.38 
 
 		 574 aa  233  8.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  28.85 
 
 		 545 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  32.41 
 
 		 561 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  29.46 
 
 		 581 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  31.9 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  31.9 
 
 		 562 aa  226  8e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  30.4 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.4 
 
 		 564 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  31.55 
 
 		 562 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  28.93 
 
 		 568 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  28.52 
 
 		 586 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  29.08 
 
 		 581 aa  219  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  29.76 
 
 		 564 aa  217  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  29.67 
 
 		 529 aa  213  9e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  29.53 
 
 		 537 aa  212  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  29 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  29.61 
 
 		 577 aa  211  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  29.08 
 
 		 577 aa  209  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  27.25 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.75 
 
 		 580 aa  207  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.5 
 
 		 565 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  29.36 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  29.13 
 
 		 537 aa  205  2e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  28 
 
 		 542 aa  203  7e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  27.42 
 
 		 581 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.37 
 
 		 581 aa  199  7e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  28.81 
 
 		 535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  27.4 
 
 		 542 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  29.42 
 
 		 535 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.63 
 
 		 540 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  27.67 
 
 		 574 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  27.58 
 
 		 581 aa  196  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  28.66 
 
 		 561 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  28.65 
 
 		 572 aa  192  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.52 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  27.89 
 
 		 510 aa  190  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  28.28 
 
 		 579 aa  190  5e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  26.55 
 
 		 563 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  26.49 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  25.82 
 
 		 602 aa  183  7e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  27.64 
 
 		 540 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  28.66 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.48 
 
 		 563 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.48 
 
 		 563 aa  178  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.81 
 
 		 591 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  25.83 
 
 		 583 aa  176  9e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.62 
 
 		 562 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.62 
 
 		 590 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.12 
 
 		 571 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  25.38 
 
 		 569 aa  172  1e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  26.18 
 
 		 550 aa  167  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.72 
 
 		 602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  25.43 
 
 		 556 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  29.63 
 
 		 455 aa  160  5e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  32.36 
 
 		 356 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.89 
 
 		 528 aa  158  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  25.7 
 
 		 503 aa  152  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  26.42 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  22.59 
 
 		 588 aa  151  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  22.01 
 
 		 593 aa  143  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  26.13 
 
 		 584 aa  144  6e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  25.69 
 
 		 570 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  35.41 
 
 		 229 aa  128  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  36.09 
 
 		 169 aa  126  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  23.09 
 
 		 604 aa  125  2e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  21.51 
 
 		 629 aa  118  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  22.78 
 
 		 611 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.65 
 
 		 606 aa  104  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.65 
 
 		 606 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  23.86 
 
 		 569 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.92 
 
 		 523 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.92 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  23.66 
 
 		 569 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  24.94 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  24.67 
 
 		 626 aa  95.5  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  25 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>