136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE1471 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 
541 aa  1103    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  84.79 
 
 
543 aa  955    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  38.78 
 
 
521 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  36.42 
 
 
535 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.65 
 
 
535 aa  280  4e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  32.04 
 
 
557 aa  277  3e-73  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.77 
 
 
534 aa  274  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.78 
 
 
534 aa  271  2e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  34.46 
 
 
565 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  35.91 
 
 
849 aa  266  5e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  31.36 
 
 
553 aa  263  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  32.62 
 
 
590 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  32.62 
 
 
590 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  32.62 
 
 
590 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  32.92 
 
 
546 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  30.86 
 
 
585 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.68 
 
 
552 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  29.9 
 
 
561 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.06 
 
 
581 aa  250  4e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  29.9 
 
 
569 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  33.27 
 
 
566 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  31.38 
 
 
565 aa  243  7e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  32.15 
 
 
574 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  30.69 
 
 
568 aa  236  6e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  31.49 
 
 
564 aa  236  9e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  32.34 
 
 
562 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  32.34 
 
 
562 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  29.44 
 
 
530 aa  233  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  33.27 
 
 
561 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  29.01 
 
 
564 aa  232  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  30.28 
 
 
581 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  29.02 
 
 
545 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  33.33 
 
 
562 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  33.33 
 
 
562 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  32.87 
 
 
562 aa  226  8e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  31.93 
 
 
498 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  30.21 
 
 
586 aa  225  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  30.89 
 
 
529 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  29.83 
 
 
577 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  29.72 
 
 
581 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  31.25 
 
 
537 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  28.34 
 
 
556 aa  220  5e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  31.17 
 
 
537 aa  219  8.999999999999998e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  28.99 
 
 
577 aa  216  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  29.98 
 
 
535 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.98 
 
 
580 aa  212  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  28.71 
 
 
574 aa  211  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  30.69 
 
 
579 aa  211  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  28.99 
 
 
558 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  27.19 
 
 
565 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  29.1 
 
 
581 aa  209  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.53 
 
 
581 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  29.24 
 
 
535 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.27 
 
 
540 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.22 
 
 
510 aa  199  7e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  27.82 
 
 
573 aa  199  9e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  30.33 
 
 
572 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.24 
 
 
542 aa  197  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.54 
 
 
581 aa  197  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  27.38 
 
 
542 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.75 
 
 
602 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.94 
 
 
561 aa  190  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  29.72 
 
 
563 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  29.72 
 
 
563 aa  188  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.72 
 
 
546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.57 
 
 
590 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.57 
 
 
562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  27.05 
 
 
563 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  26.98 
 
 
583 aa  183  9.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  27.39 
 
 
569 aa  183  9.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.59 
 
 
571 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.57 
 
 
591 aa  182  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  27.98 
 
 
550 aa  181  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  29.66 
 
 
491 aa  179  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  26.48 
 
 
540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.13 
 
 
503 aa  170  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.02 
 
 
556 aa  167  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.81 
 
 
555 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  29.44 
 
 
455 aa  162  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.35 
 
 
528 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  24.01 
 
 
602 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  24.62 
 
 
588 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  33.43 
 
 
356 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  43.2 
 
 
169 aa  152  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  25.53 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  24.47 
 
 
604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.88 
 
 
629 aa  140  6e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  21.99 
 
 
593 aa  133  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  36.79 
 
 
229 aa  131  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  26.02 
 
 
570 aa  124  3e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.45 
 
 
606 aa  109  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.45 
 
 
606 aa  108  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  24.86 
 
 
626 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  22.02 
 
 
611 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.75 
 
 
555 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  25.48 
 
 
558 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  24.89 
 
 
534 aa  99  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  23.01 
 
 
555 aa  98.2  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.07 
 
 
525 aa  97.8  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  26.07 
 
 
523 aa  98.2  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>