137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_1289 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  100 
 
 
521 aa  1080    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  51.15 
 
 
535 aa  507  9.999999999999999e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  51.34 
 
 
534 aa  502  1e-141  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  51.15 
 
 
534 aa  500  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  48.48 
 
 
535 aa  491  1e-137  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  48.82 
 
 
849 aa  444  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  43.76 
 
 
557 aa  426  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  38.78 
 
 
541 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  39.56 
 
 
552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  37.27 
 
 
590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  37.27 
 
 
590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  37.27 
 
 
590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  37.73 
 
 
543 aa  340  4e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  39.14 
 
 
581 aa  338  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  38.18 
 
 
565 aa  332  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  37.5 
 
 
564 aa  331  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  36.38 
 
 
581 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  35.8 
 
 
558 aa  321  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  36.19 
 
 
581 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  37.9 
 
 
585 aa  321  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  35.51 
 
 
568 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  35.09 
 
 
561 aa  309  8e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  36.03 
 
 
546 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  34.89 
 
 
569 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  37.68 
 
 
553 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  35.14 
 
 
556 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  34.57 
 
 
562 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  34.57 
 
 
562 aa  300  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  34.57 
 
 
562 aa  300  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  35.23 
 
 
562 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  35.23 
 
 
562 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  36.15 
 
 
586 aa  296  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  35.74 
 
 
545 aa  296  8e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  35.76 
 
 
530 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  34.31 
 
 
563 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  33.21 
 
 
602 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  34.56 
 
 
565 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  33.98 
 
 
561 aa  280  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  34.16 
 
 
574 aa  278  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  31.78 
 
 
580 aa  276  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  33.07 
 
 
581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  33.53 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  34.58 
 
 
550 aa  273  6e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  33.14 
 
 
537 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  33 
 
 
542 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  34.97 
 
 
546 aa  270  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  33 
 
 
542 aa  269  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  34.69 
 
 
498 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  33.78 
 
 
535 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  35.55 
 
 
583 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  34.9 
 
 
581 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  33.53 
 
 
529 aa  261  2e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  31.65 
 
 
588 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  33.66 
 
 
510 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  32.11 
 
 
574 aa  256  6e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  33.13 
 
 
535 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  31.13 
 
 
577 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  34.86 
 
 
561 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  32.48 
 
 
566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  31.46 
 
 
573 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  34.29 
 
 
540 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  31.46 
 
 
577 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  30.8 
 
 
564 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  30.87 
 
 
602 aa  251  3e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  32.39 
 
 
528 aa  243  5e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  32.68 
 
 
540 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  31.19 
 
 
503 aa  239  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  32.98 
 
 
491 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  30.35 
 
 
579 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  51.77 
 
 
229 aa  226  6e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.29 
 
 
591 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.29 
 
 
562 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.29 
 
 
590 aa  223  6e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  31.63 
 
 
563 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  31.63 
 
 
563 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  30.84 
 
 
604 aa  219  7.999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  29.5 
 
 
565 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.61 
 
 
555 aa  204  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  29.09 
 
 
584 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  27.08 
 
 
581 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  27.27 
 
 
571 aa  187  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  27.92 
 
 
572 aa  187  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  29.67 
 
 
455 aa  177  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  31.44 
 
 
356 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  48.32 
 
 
169 aa  158  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  26.62 
 
 
606 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  25.33 
 
 
593 aa  150  6e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.92 
 
 
606 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  27.66 
 
 
556 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  25.77 
 
 
611 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  24.78 
 
 
629 aa  141  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  26.12 
 
 
558 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  22.42 
 
 
569 aa  134  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  24.58 
 
 
570 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  40.99 
 
 
215 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  26.4 
 
 
489 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  55.75 
 
 
163 aa  122  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  27.13 
 
 
489 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  27.13 
 
 
489 aa  116  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  24.67 
 
 
555 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>