128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0623 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  100 
 
 
566 aa  1187    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  79.42 
 
 
564 aa  957    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  50.97 
 
 
565 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  49.83 
 
 
572 aa  543  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  41.59 
 
 
579 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  39.97 
 
 
571 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  37.44 
 
 
581 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  34.55 
 
 
590 aa  324  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  34.55 
 
 
590 aa  324  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  34.55 
 
 
590 aa  324  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  35.03 
 
 
565 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  34.37 
 
 
564 aa  317  3e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  33.58 
 
 
556 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  33.57 
 
 
581 aa  300  3e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  35.4 
 
 
585 aa  296  6e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  33.95 
 
 
569 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  33.89 
 
 
561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  33.15 
 
 
553 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  32.23 
 
 
590 aa  287  5e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  32.23 
 
 
562 aa  286  5e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  32.23 
 
 
591 aa  286  9e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  35.02 
 
 
573 aa  282  9e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  32.52 
 
 
577 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  33.04 
 
 
581 aa  271  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  32.97 
 
 
552 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  32.17 
 
 
577 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  31.75 
 
 
574 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  29.98 
 
 
569 aa  266  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  32.81 
 
 
534 aa  263  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  33.27 
 
 
535 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  32.61 
 
 
534 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  35.07 
 
 
849 aa  256  8e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  33.4 
 
 
535 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  32.2 
 
 
565 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  32.66 
 
 
557 aa  253  5.000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  31.18 
 
 
558 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  32.97 
 
 
563 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  32.97 
 
 
563 aa  250  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  30.88 
 
 
562 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  30.88 
 
 
562 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  30.04 
 
 
546 aa  246  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  32.48 
 
 
521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  33.27 
 
 
541 aa  244  3e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  30.63 
 
 
568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.82 
 
 
562 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.82 
 
 
562 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  30.57 
 
 
561 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  30.62 
 
 
562 aa  238  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  31.39 
 
 
586 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  32.02 
 
 
543 aa  233  5e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  30.05 
 
 
574 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.67 
 
 
602 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  28.07 
 
 
581 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  28.47 
 
 
581 aa  219  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.57 
 
 
581 aa  206  9e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  27.16 
 
 
583 aa  204  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  27.7 
 
 
563 aa  203  8e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  28.6 
 
 
550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  28.72 
 
 
530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.51 
 
 
602 aa  194  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  28.51 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  28.2 
 
 
584 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  26.08 
 
 
604 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  31.63 
 
 
455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  27.54 
 
 
537 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  27.35 
 
 
537 aa  177  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  29.58 
 
 
580 aa  177  5e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  26.36 
 
 
555 aa  174  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  25.52 
 
 
588 aa  172  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  29.85 
 
 
498 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  26.29 
 
 
542 aa  168  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.46 
 
 
542 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  37.74 
 
 
229 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  28.9 
 
 
491 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  28.31 
 
 
510 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.98 
 
 
535 aa  161  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  25.94 
 
 
540 aa  158  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  31.18 
 
 
356 aa  156  7e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  25.9 
 
 
540 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.81 
 
 
556 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.15 
 
 
545 aa  155  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.22 
 
 
535 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  25.87 
 
 
629 aa  151  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  26.67 
 
 
529 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  25.69 
 
 
626 aa  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.49 
 
 
593 aa  137  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.78 
 
 
606 aa  136  9e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  24.32 
 
 
629 aa  136  9e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.78 
 
 
606 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.84 
 
 
546 aa  134  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  25.24 
 
 
525 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  25.24 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  24.49 
 
 
611 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  25.1 
 
 
503 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  22.27 
 
 
555 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  22.11 
 
 
555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  24.18 
 
 
534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  36.08 
 
 
169 aa  110  5e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.25 
 
 
555 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  22.98 
 
 
553 aa  105  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>