128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1563 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  100 
 
 		 561 aa  1162    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  98.57 
 
 		 569 aa  1148    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  51.31 
 
 		 564 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  51.43 
 
 		 581 aa  553  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  48.42 
 
 		 556 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  47.06 
 
 		 574 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  46.28 
 
 		 577 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  46.1 
 
 		 577 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  42.34 
 
 		 573 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  43.19 
 
 		 565 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  41.98 
 
 		 581 aa  424  1e-117  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  36.59 
 
 		 585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  31.91 
 
 		 590 aa  310  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  31.91 
 
 		 590 aa  310  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  31.91 
 
 		 590 aa  310  5e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.09 
 
 		 521 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  34.35 
 
 		 568 aa  290  7e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  33.89 
 
 		 566 aa  287  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.78 
 
 		 557 aa  286  5e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  32.4 
 
 		 564 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  32.78 
 
 		 565 aa  279  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  32.35 
 
 		 586 aa  276  5e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  32.74 
 
 		 534 aa  276  7e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  32.74 
 
 		 534 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  31.86 
 
 		 574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  32.55 
 
 		 535 aa  270  7e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  32.41 
 
 		 535 aa  265  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  38.93 
 
 		 455 aa  259  7e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  32.68 
 
 		 849 aa  258  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  31.4 
 
 		 553 aa  256  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.9 
 
 		 541 aa  253  8.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.76 
 
 		 591 aa  239  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.76 
 
 		 590 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.76 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  29.74 
 
 		 565 aa  236  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  28.12 
 
 		 543 aa  236  8e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  29.42 
 
 		 581 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  30.62 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  28.7 
 
 		 581 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.16 
 
 		 562 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.16 
 
 		 562 aa  225  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.19 
 
 		 581 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  29.28 
 
 		 572 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  29.98 
 
 		 562 aa  224  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  30.73 
 
 		 561 aa  223  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  28.23 
 
 		 558 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.99 
 
 		 581 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  29.8 
 
 		 580 aa  217  5e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  30.4 
 
 		 562 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  30.4 
 
 		 562 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  30.75 
 
 		 546 aa  215  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.25 
 
 		 602 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.57 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.7 
 
 		 563 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.7 
 
 		 563 aa  209  8e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  28.73 
 
 		 550 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  27.71 
 
 		 563 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.4 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  27.54 
 
 		 537 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.88 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  26.55 
 
 		 537 aa  181  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.83 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.16 
 
 		 542 aa  176  8e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  27.67 
 
 		 583 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  27.01 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.53 
 
 		 535 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  26.53 
 
 		 542 aa  170  8e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  26.52 
 
 		 629 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.31 
 
 		 530 aa  168  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.17 
 
 		 546 aa  164  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  25.89 
 
 		 556 aa  160  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.51 
 
 		 535 aa  160  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  23.92 
 
 		 588 aa  159  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.1 
 
 		 545 aa  159  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  26.09 
 
 		 561 aa  154  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  24.3 
 
 		 604 aa  153  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.34 
 
 		 602 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.63 
 
 		 584 aa  149  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.69 
 
 		 510 aa  141  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.51 
 
 		 555 aa  140  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  26.52 
 
 		 503 aa  137  4e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  26.58 
 
 		 498 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  24.23 
 
 		 529 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.28 
 
 		 593 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.52 
 
 		 491 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  32.52 
 
 		 229 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.59 
 
 		 356 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  45.45 
 
 		 163 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.39 
 
 		 528 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  37.7 
 
 		 215 aa  113  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1652  hypothetical protein  54.95 
 
 		 92 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  22.79 
 
 		 570 aa  110  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  23.29 
 
 		 629 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  26.68 
 
 		 569 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.95 
 
 		 606 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  26.1 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.95 
 
 		 606 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  21.89 
 
 		 534 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  23.14 
 
 		 611 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  30.67 
 
 		 169 aa  94.7  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>