132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7332 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  100 
 
 
581 aa  1202    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  51.25 
 
 
569 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  51.43 
 
 
561 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  49.48 
 
 
564 aa  566  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  47.7 
 
 
556 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  47.43 
 
 
577 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  46.58 
 
 
577 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  44.95 
 
 
573 aa  498  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  44.92 
 
 
574 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  42.64 
 
 
565 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  41.29 
 
 
581 aa  411  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  36.7 
 
 
568 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  36.5 
 
 
585 aa  312  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  32.83 
 
 
590 aa  299  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  32.83 
 
 
590 aa  299  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  32.83 
 
 
590 aa  299  1e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  32.44 
 
 
565 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  33.04 
 
 
566 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  31.75 
 
 
564 aa  272  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  40.92 
 
 
455 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  34.9 
 
 
521 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  32.98 
 
 
553 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  31.76 
 
 
574 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  30.64 
 
 
572 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  31.87 
 
 
586 aa  241  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  29.16 
 
 
579 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  30.22 
 
 
557 aa  238  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.45 
 
 
591 aa  233  6e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  32.12 
 
 
534 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.51 
 
 
562 aa  233  9e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  29.33 
 
 
590 aa  231  3e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  29.79 
 
 
565 aa  231  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  30.92 
 
 
581 aa  230  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  31.73 
 
 
534 aa  229  1e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  31.18 
 
 
535 aa  223  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  31.46 
 
 
535 aa  220  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  30.92 
 
 
552 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  28.6 
 
 
563 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  28.6 
 
 
563 aa  219  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  29.47 
 
 
571 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  29.1 
 
 
541 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  31.22 
 
 
849 aa  213  5.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  28.27 
 
 
558 aa  212  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  27.58 
 
 
543 aa  203  7e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  31.14 
 
 
562 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  31.14 
 
 
562 aa  200  7e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.72 
 
 
581 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  27.37 
 
 
581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  30.32 
 
 
546 aa  197  5.000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  28.95 
 
 
562 aa  196  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  28.4 
 
 
561 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.26 
 
 
562 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.26 
 
 
562 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.91 
 
 
580 aa  191  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.65 
 
 
602 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  29 
 
 
550 aa  184  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.2 
 
 
581 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  28.28 
 
 
563 aa  182  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  30.44 
 
 
583 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  31.72 
 
 
604 aa  171  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  27.47 
 
 
629 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  27.33 
 
 
602 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  28.45 
 
 
556 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  26.39 
 
 
588 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  29.68 
 
 
546 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.48 
 
 
569 aa  152  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.57 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  25.51 
 
 
545 aa  146  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.87 
 
 
584 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  25.32 
 
 
537 aa  144  3e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  26.19 
 
 
535 aa  144  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.11 
 
 
540 aa  144  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  25.32 
 
 
537 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.86 
 
 
510 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  23.93 
 
 
542 aa  136  9e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.58 
 
 
561 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  26.2 
 
 
540 aa  135  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.74 
 
 
542 aa  134  5e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.24 
 
 
535 aa  127  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.36 
 
 
491 aa  120  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  43.75 
 
 
163 aa  116  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.38 
 
 
593 aa  113  9e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  39.62 
 
 
215 aa  107  5e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  25.57 
 
 
611 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  22.69 
 
 
555 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  24.38 
 
 
629 aa  105  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  24.42 
 
 
606 aa  104  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  24.45 
 
 
534 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  28.05 
 
 
606 aa  103  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1649  Phage terminase-like protein, large subunit  22.84 
 
 
626 aa  101  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1652  hypothetical protein  53.85 
 
 
92 aa  100  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  26.65 
 
 
498 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  32.89 
 
 
229 aa  99.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  25.2 
 
 
356 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  24.07 
 
 
529 aa  94  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  26.08 
 
 
503 aa  93.2  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  24.05 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  23.35 
 
 
557 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  20.9 
 
 
570 aa  76.6  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  25.38 
 
 
525 aa  72  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>