134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1472 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  100 
 
 		 537 aa  1108    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  97.95 
 
 		 537 aa  1065    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  74.55 
 
 		 535 aa  797    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  74.35 
 
 		 535 aa  772    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  60.5 
 
 		 530 aa  627  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  54.32 
 
 		 545 aa  581  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  52.45 
 
 		 542 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  52.26 
 
 		 542 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  52.92 
 
 		 540 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  50.94 
 
 		 540 aa  523  1e-147  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  50.56 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  49.21 
 
 		 510 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  34.91 
 
 		 534 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  34.91 
 
 		 534 aa  277  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  34.51 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  34.85 
 
 		 535 aa  266  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  33.53 
 
 		 521 aa  266  7e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  33.41 
 
 		 849 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  31.25 
 
 		 541 aa  228  2e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29.53 
 
 		 543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  29.27 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  28.07 
 
 		 528 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  30.04 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  29.05 
 
 		 558 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  27.2 
 
 		 556 aa  198  3e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.54 
 
 		 561 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.26 
 
 		 564 aa  196  9e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  30.82 
 
 		 491 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  27.2 
 
 		 569 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  28.21 
 
 		 529 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  25.73 
 
 		 590 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  28.02 
 
 		 585 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  25.73 
 
 		 590 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  25.73 
 
 		 590 aa  190  5.999999999999999e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  29.32 
 
 		 503 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  30.44 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  28.21 
 
 		 581 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  28.27 
 
 		 581 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  27.51 
 
 		 563 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.29 
 
 		 602 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  27.35 
 
 		 566 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  28.37 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  28.12 
 
 		 565 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  25.98 
 
 		 565 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  27.54 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  25.89 
 
 		 564 aa  179  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  42.08 
 
 		 229 aa  173  6.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  27.03 
 
 		 568 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  29.25 
 
 		 583 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  27.5 
 
 		 550 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  27.15 
 
 		 581 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  25.1 
 
 		 565 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  25.96 
 
 		 553 aa  162  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.92 
 
 		 586 aa  160  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  26.72 
 
 		 574 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  25.89 
 
 		 581 aa  156  7e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  25.05 
 
 		 574 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  28.24 
 
 		 546 aa  154  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.57 
 
 		 577 aa  153  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  25.41 
 
 		 581 aa  151  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  23.62 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  25.1 
 
 		 588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.15 
 
 		 590 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.15 
 
 		 562 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  25.15 
 
 		 555 aa  148  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  25.15 
 
 		 591 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  23.43 
 
 		 579 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  26.84 
 
 		 561 aa  146  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  24.46 
 
 		 573 aa  144  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.23 
 
 		 602 aa  139  8.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  26.81 
 
 		 629 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  23.95 
 
 		 604 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.03 
 
 		 611 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  25.39 
 
 		 606 aa  134  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  23.83 
 
 		 563 aa  133  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  23.83 
 
 		 563 aa  133  9e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  25.39 
 
 		 606 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.46 
 
 		 562 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.46 
 
 		 562 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  25.86 
 
 		 584 aa  130  9.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.86 
 
 		 562 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  25 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  25 
 
 		 562 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  24.85 
 
 		 556 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  22.16 
 
 		 581 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  21.96 
 
 		 572 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  40.41 
 
 		 169 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  22.41 
 
 		 571 aa  117  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.34 
 
 		 455 aa  116  8.999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  20.99 
 
 		 569 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  22.74 
 
 		 593 aa  114  5e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  22.34 
 
 		 534 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  24.66 
 
 		 504 aa  90.9  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  23.14 
 
 		 356 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  22.96 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  22.99 
 
 		 569 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  23.18 
 
 		 569 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  22.77 
 
 		 553 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  23.69 
 
 		 553 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  20.71 
 
 		 523 aa  79  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>