134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08190 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  100 
 
 
546 aa  1138    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  50.45 
 
 
562 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  50.45 
 
 
562 aa  555  1e-157  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  50.82 
 
 
562 aa  555  1e-157  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  51.18 
 
 
562 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  51.18 
 
 
562 aa  554  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  50.36 
 
 
561 aa  549  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  41.56 
 
 
565 aa  398  1e-109  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  51.55 
 
 
356 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  36.62 
 
 
563 aa  332  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  36.62 
 
 
563 aa  332  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  36.03 
 
 
521 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  34.14 
 
 
590 aa  293  7e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  34.21 
 
 
562 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  33.94 
 
 
591 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  32.9 
 
 
568 aa  280  5e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  34.08 
 
 
557 aa  271  2e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  31.84 
 
 
581 aa  265  1e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  32.19 
 
 
585 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  34.27 
 
 
535 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  29.04 
 
 
590 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  29.04 
 
 
590 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  29.04 
 
 
590 aa  261  2e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  32.92 
 
 
541 aa  261  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  35.39 
 
 
535 aa  259  6e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  32.16 
 
 
543 aa  256  6e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  36.77 
 
 
849 aa  247  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  30.04 
 
 
566 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  34.27 
 
 
534 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  34.27 
 
 
534 aa  243  5e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  32.29 
 
 
581 aa  241  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  31.73 
 
 
581 aa  238  3e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  31.4 
 
 
556 aa  232  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  30.77 
 
 
558 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  29.13 
 
 
572 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  28.94 
 
 
553 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  31.81 
 
 
586 aa  223  4.9999999999999996e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  31.76 
 
 
565 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.92 
 
 
564 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  28.49 
 
 
564 aa  219  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  29.68 
 
 
569 aa  216  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  30.27 
 
 
552 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  30.75 
 
 
561 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  28.73 
 
 
565 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  30.31 
 
 
577 aa  213  9e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  31.12 
 
 
574 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  28 
 
 
579 aa  209  9e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.7 
 
 
581 aa  208  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  28.91 
 
 
577 aa  207  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  26.48 
 
 
581 aa  206  9e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  48.99 
 
 
215 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  28.97 
 
 
602 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  30.32 
 
 
581 aa  193  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  27.77 
 
 
573 aa  193  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  28.45 
 
 
604 aa  187  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  28.78 
 
 
574 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  29.15 
 
 
563 aa  182  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  30.83 
 
 
583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  30.02 
 
 
602 aa  180  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  29.23 
 
 
550 aa  179  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  27.46 
 
 
588 aa  179  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  28.92 
 
 
537 aa  177  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  29.15 
 
 
498 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  26.43 
 
 
571 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  28.37 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  26.92 
 
 
529 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  26.33 
 
 
570 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.88 
 
 
530 aa  170  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  26.13 
 
 
569 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.54 
 
 
580 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.02 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.59 
 
 
540 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  25.6 
 
 
542 aa  163  8.000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.3 
 
 
542 aa  162  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  27.82 
 
 
546 aa  160  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  27.15 
 
 
540 aa  157  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  25.75 
 
 
561 aa  156  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  26.75 
 
 
584 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.86 
 
 
510 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.73 
 
 
535 aa  149  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.27 
 
 
528 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.31 
 
 
535 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  25.65 
 
 
556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  26.11 
 
 
503 aa  133  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  26.23 
 
 
534 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  25.04 
 
 
611 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  24.57 
 
 
606 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  24.57 
 
 
606 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.58 
 
 
491 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.47 
 
 
593 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  23.78 
 
 
555 aa  128  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  24.32 
 
 
555 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  23.6 
 
 
555 aa  125  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  27.22 
 
 
455 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  22.2 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  22.2 
 
 
553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  24.32 
 
 
558 aa  114  6e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  36.84 
 
 
229 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2702  putative phage terminase, large subunit  21.74 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  41.1 
 
 
163 aa  105  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>