152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1722 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  76.01 
 
 		 535 aa  717    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  78.22 
 
 		 534 aa  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  78.22 
 
 		 534 aa  730    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  100 
 
 		 849 aa  1768    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  79.78 
 
 		 535 aa  742    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  48.61 
 
 		 521 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  75.98 
 
 		 229 aa  378  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  36.21 
 
 		 557 aa  291  3e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  37.1 
 
 		 558 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  36.91 
 
 		 581 aa  274  6e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  36.1 
 
 		 581 aa  274  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  33.84 
 
 		 581 aa  272  2e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  37.06 
 
 		 530 aa  270  8e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  35.02 
 
 		 565 aa  270  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  35.91 
 
 		 541 aa  266  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  36.32 
 
 		 562 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  36.32 
 
 		 562 aa  259  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  32.84 
 
 		 563 aa  259  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  32.68 
 
 		 561 aa  258  5e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  35.07 
 
 		 566 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  32.68 
 
 		 569 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  34.94 
 
 		 562 aa  255  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  34.94 
 
 		 562 aa  255  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  34.19 
 
 		 543 aa  253  7e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  34.46 
 
 		 585 aa  254  7e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  32.97 
 
 		 602 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  32.54 
 
 		 580 aa  253  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  33.56 
 
 		 537 aa  252  2e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  34.48 
 
 		 562 aa  251  3e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  32.81 
 
 		 564 aa  251  4e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  33.56 
 
 		 537 aa  250  7e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  35.2 
 
 		 564 aa  250  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  34.7 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  32.64 
 
 		 590 aa  249  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  32.64 
 
 		 590 aa  249  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  32.64 
 
 		 590 aa  249  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  36.77 
 
 		 546 aa  247  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  34.84 
 
 		 586 aa  246  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  32.6 
 
 		 553 aa  243  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  32.27 
 
 		 556 aa  243  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  32.67 
 
 		 545 aa  240  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  34.18 
 
 		 561 aa  239  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  34.01 
 
 		 542 aa  237  7e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  34.56 
 
 		 574 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  34.49 
 
 		 498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  34.46 
 
 		 542 aa  235  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  30.89 
 
 		 510 aa  234  5e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  32.88 
 
 		 550 aa  233  1e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  34.25 
 
 		 561 aa  230  8e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  31.82 
 
 		 573 aa  228  5.0000000000000005e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  31.9 
 
 		 529 aa  226  1e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  31.42 
 
 		 581 aa  226  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  33.19 
 
 		 540 aa  225  3e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  31.82 
 
 		 552 aa  224  8e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  29.83 
 
 		 588 aa  223  9.999999999999999e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  32.89 
 
 		 503 aa  222  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  32.65 
 
 		 535 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  33.62 
 
 		 491 aa  219  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  32.2 
 
 		 583 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  31.74 
 
 		 555 aa  218  4e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  32.52 
 
 		 565 aa  218  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  31.69 
 
 		 577 aa  218  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  31.86 
 
 		 535 aa  217  7e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  32.54 
 
 		 568 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  33.94 
 
 		 565 aa  215  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  31.05 
 
 		 577 aa  214  7e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  32.26 
 
 		 540 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  31.22 
 
 		 581 aa  207  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  30.42 
 
 		 604 aa  207  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  29.35 
 
 		 574 aa  204  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  31.06 
 
 		 591 aa  202  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  31.06 
 
 		 590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  31.06 
 
 		 562 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  32.27 
 
 		 782 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  32.27 
 
 		 782 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  30.91 
 
 		 579 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  28.43 
 
 		 602 aa  194  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  35.19 
 
 		 1118 aa  191  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  31.48 
 
 		 455 aa  188  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  30.41 
 
 		 572 aa  188  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  28.94 
 
 		 528 aa  185  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  32.55 
 
 		 824 aa  185  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  29.42 
 
 		 571 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  33.53 
 
 		 356 aa  184  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  30.73 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  30.73 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  30.69 
 
 		 584 aa  181  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1007  putative ATP-dependent DNA helicase  33.33 
 
 		 397 aa  157  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  27.39 
 
 		 581 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  44.31 
 
 		 169 aa  157  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  26.82 
 
 		 629 aa  154  8e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  30.69 
 
 		 772 aa  146  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  27.23 
 
 		 832 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  31.69 
 
 		 913 aa  136  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  29.36 
 
 		 749 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  27.74 
 
 		 556 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  26.52 
 
 		 570 aa  129  3e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  26.29 
 
 		 606 aa  127  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  26.24 
 
 		 606 aa  124  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  27.07 
 
 		 611 aa  124  6e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>