19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1007 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1007  putative ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 
397 aa  817    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4657  DnaB domain-containing protein  36.14 
 
 
824 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.186052  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5366  DnaB helicase-like protein  35.96 
 
 
782 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5455  DnaB domain-containing protein  35.96 
 
 
782 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.049604  normal  0.0110505 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  33.33 
 
 
849 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5063  replicative DNA helicase  31.67 
 
 
871 aa  150  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.946946  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0878  DnaB domain-containing protein  30.73 
 
 
879 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  32.77 
 
 
1118 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4838  replicative DNA helicase  31.35 
 
 
865 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5363  replicative DNA helicase  27.99 
 
 
832 aa  108  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7043  replicative DNA helicase  32.16 
 
 
772 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6030  DnaB domain-containing protein  37.04 
 
 
863 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1249  PhoH family protein  30.95 
 
 
654 aa  99.8  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00823  phage uncharacterized protein  28.21 
 
 
913 aa  95.9  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0424  DnaB domain-containing protein  26.91 
 
 
831 aa  93.2  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000384079  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1893  DnaB domain-containing protein  28.61 
 
 
807 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100629  unclonable  0.0000000000808467 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4735  replicative DNA helicase  32.02 
 
 
749 aa  91.3  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3033  DnaB-like helicase-like  27.32 
 
 
821 aa  73.9  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.00000237623  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4942  replicative DNA helicase  48.53 
 
 
939 aa  72.4  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>