120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2503 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2503  Terminase  100 
 
 		 602 aa  1243    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  48.98 
 
 		 583 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  44.52 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  43.78 
 
 		 581 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  43.78 
 
 		 581 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  43.77 
 
 		 604 aa  446  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  39.32 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  39.97 
 
 		 602 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  41.44 
 
 		 550 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  37.26 
 
 		 588 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  38.04 
 
 		 563 aa  363  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  32.56 
 
 		 593 aa  279  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  31.81 
 
 		 552 aa  271  4e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  31.2 
 
 		 557 aa  261  4e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  30.64 
 
 		 606 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  30.64 
 
 		 606 aa  243  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  32.53 
 
 		 611 aa  242  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  30.87 
 
 		 521 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  30.43 
 
 		 535 aa  228  2e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  30.31 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  29.27 
 
 		 535 aa  222  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  30.14 
 
 		 534 aa  221  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  28.11 
 
 		 556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  27.43 
 
 		 565 aa  207  5e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  26.14 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  26.14 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  26.14 
 
 		 590 aa  207  6e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  28.57 
 
 		 568 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  28.74 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  28.63 
 
 		 849 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  27.55 
 
 		 581 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  27.01 
 
 		 573 aa  194  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  25.51 
 
 		 566 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  29.46 
 
 		 565 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  27.18 
 
 		 574 aa  189  9e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  27.44 
 
 		 553 aa  189  9e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.55 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.55 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.26 
 
 		 585 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.64 
 
 		 562 aa  187  5e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.64 
 
 		 590 aa  187  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  27.99 
 
 		 565 aa  186  8e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  28.34 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  28.34 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.64 
 
 		 591 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  28.97 
 
 		 571 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  26.43 
 
 		 563 aa  181  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  26.43 
 
 		 563 aa  181  4.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  28.51 
 
 		 562 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  28.06 
 
 		 546 aa  180  8e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  26.7 
 
 		 577 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  28.22 
 
 		 561 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  23.43 
 
 		 564 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  28.12 
 
 		 579 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  27 
 
 		 572 aa  170  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  25.37 
 
 		 577 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  23.72 
 
 		 543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  24.83 
 
 		 574 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  26.69 
 
 		 581 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  24.34 
 
 		 541 aa  161  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  27.17 
 
 		 581 aa  160  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  27.84 
 
 		 498 aa  153  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.23 
 
 		 530 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  25.34 
 
 		 561 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  25.34 
 
 		 569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  23.29 
 
 		 580 aa  148  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  26.22 
 
 		 586 aa  148  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.8 
 
 		 546 aa  143  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  25.17 
 
 		 529 aa  143  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26 
 
 		 491 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  53.73 
 
 		 163 aa  138  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  23.85 
 
 		 569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  23.91 
 
 		 528 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  25.23 
 
 		 537 aa  134  6.999999999999999e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  25.05 
 
 		 537 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  24.36 
 
 		 540 aa  125  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25.32 
 
 		 535 aa  124  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  23.62 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.18 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  23.85 
 
 		 542 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  23.02 
 
 		 584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.4 
 
 		 542 aa  113  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  24.03 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  23.25 
 
 		 570 aa  104  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  21.72 
 
 		 545 aa  104  6e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  22.9 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  22.66 
 
 		 561 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  23.14 
 
 		 629 aa  99  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  22.36 
 
 		 540 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  22.99 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  32.64 
 
 		 215 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  28.41 
 
 		 229 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  23.55 
 
 		 556 aa  90.1  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  25.7 
 
 		 356 aa  89  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4976  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  24.48 
 
 		 525 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5356  prophage LambdaBa03, terminase, large subunit  24.48 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.74 
 
 		 555 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.74 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  25.26 
 
 		 169 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  21.89 
 
 		 555 aa  72  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>