132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1631 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1631  terminase  100 
 
 		 586 aa  1215    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  35.19 
 
 		 585 aa  311  2e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  33.21 
 
 		 564 aa  288  2e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.41 
 
 		 521 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  32.7 
 
 		 569 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  32.35 
 
 		 561 aa  276  6e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  32.1 
 
 		 556 aa  272  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  33.03 
 
 		 581 aa  267  2.9999999999999995e-70  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  33.66 
 
 		 557 aa  268  2.9999999999999995e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  33.93 
 
 		 534 aa  259  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  33.46 
 
 		 535 aa  257  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  29.75 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  29.75 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  29.75 
 
 		 590 aa  256  7e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  35.16 
 
 		 535 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  33.73 
 
 		 534 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  34.19 
 
 		 565 aa  249  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  34.84 
 
 		 849 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  32.49 
 
 		 568 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  31.39 
 
 		 566 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  31.93 
 
 		 552 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  31.87 
 
 		 581 aa  234  3e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  32.23 
 
 		 565 aa  233  1e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  27.71 
 
 		 564 aa  226  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  30.21 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  31.81 
 
 		 546 aa  223  4.9999999999999996e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  28.52 
 
 		 543 aa  219  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  29.64 
 
 		 573 aa  217  5.9999999999999996e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  30.3 
 
 		 565 aa  212  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  29.2 
 
 		 581 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  31.31 
 
 		 553 aa  209  8e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  28.99 
 
 		 629 aa  206  1e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  29.4 
 
 		 577 aa  206  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  28.57 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  28.39 
 
 		 581 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  28.33 
 
 		 562 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  28.33 
 
 		 562 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.45 
 
 		 577 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  28.94 
 
 		 562 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  29.05 
 
 		 563 aa  200  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  29.05 
 
 		 563 aa  200  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  26.92 
 
 		 581 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  29.02 
 
 		 529 aa  196  7e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  28.91 
 
 		 561 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  28.29 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  28.29 
 
 		 562 aa  193  7e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  28.34 
 
 		 579 aa  192  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  27.81 
 
 		 558 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.22 
 
 		 591 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  27.12 
 
 		 581 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.84 
 
 		 590 aa  186  8e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  29.8 
 
 		 530 aa  186  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  27.92 
 
 		 562 aa  186  9e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  29.3 
 
 		 545 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  26.44 
 
 		 571 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  26.78 
 
 		 602 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  26.6 
 
 		 588 aa  178  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  28.64 
 
 		 583 aa  177  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  28.97 
 
 		 550 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  28.37 
 
 		 563 aa  177  5e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  26.36 
 
 		 569 aa  176  9e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  30.41 
 
 		 510 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  28.07 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.97 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  27.47 
 
 		 498 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  25.32 
 
 		 574 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  28.74 
 
 		 561 aa  167  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  26.69 
 
 		 572 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  26.97 
 
 		 535 aa  162  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  27.35 
 
 		 537 aa  161  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  27.03 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  26.89 
 
 		 580 aa  158  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  26.92 
 
 		 537 aa  156  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  27.46 
 
 		 542 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  28.51 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  26.22 
 
 		 602 aa  148  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  27.46 
 
 		 542 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  26.88 
 
 		 546 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  25.75 
 
 		 604 aa  147  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  26.33 
 
 		 584 aa  146  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  27.03 
 
 		 606 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  38.54 
 
 		 229 aa  141  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  27.03 
 
 		 606 aa  141  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  27.03 
 
 		 503 aa  140  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  24.15 
 
 		 555 aa  137  4e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26.21 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  24.41 
 
 		 593 aa  136  9.999999999999999e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  26.34 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  28.46 
 
 		 455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  26.73 
 
 		 611 aa  126  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  23.39 
 
 		 558 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  26.12 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  22.66 
 
 		 555 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1404  terminase large subunit  32.94 
 
 		 169 aa  103  1e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  22.72 
 
 		 555 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  22.45 
 
 		 555 aa  101  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1117  phage terminase  20.68 
 
 		 629 aa  97.1  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  20.73 
 
 		 534 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  21.87 
 
 		 553 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  21.87 
 
 		 553 aa  95.1  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>