130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4462 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  72.38 
 
 
581 aa  863    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  56.71 
 
 
581 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  100 
 
 
558 aa  1162    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  72.32 
 
 
581 aa  842    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  55.18 
 
 
602 aa  598  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  55.93 
 
 
550 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  50.54 
 
 
563 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  47.66 
 
 
583 aa  527  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  45.81 
 
 
588 aa  500  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  48.04 
 
 
604 aa  498  1e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  44.31 
 
 
602 aa  495  1e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  36.68 
 
 
593 aa  358  9.999999999999999e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1994  Terminase  37.37 
 
 
611 aa  355  2e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.447036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  36.43 
 
 
606 aa  340  5e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  36.43 
 
 
606 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  35.14 
 
 
557 aa  323  4e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  35.71 
 
 
521 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  36.79 
 
 
535 aa  306  6e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  33.58 
 
 
552 aa  296  9e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  32.4 
 
 
556 aa  296  9e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  36.59 
 
 
534 aa  286  9e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  36.4 
 
 
534 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  34.02 
 
 
535 aa  283  4.0000000000000003e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  36.36 
 
 
849 aa  278  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  32.48 
 
 
564 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  32.65 
 
 
565 aa  266  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  29.55 
 
 
590 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  29.55 
 
 
590 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  29.55 
 
 
590 aa  256  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  30.42 
 
 
581 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  31.18 
 
 
566 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  30.67 
 
 
553 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  32.16 
 
 
568 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  31.04 
 
 
574 aa  238  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  30.65 
 
 
585 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  30.97 
 
 
562 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  30.97 
 
 
562 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  32.04 
 
 
562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  32.04 
 
 
562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  34.52 
 
 
498 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  29.72 
 
 
564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  30.77 
 
 
546 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  28.32 
 
 
561 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  30.27 
 
 
562 aa  230  4e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  29.01 
 
 
577 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  30.23 
 
 
571 aa  230  4e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  30.17 
 
 
581 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  27.97 
 
 
569 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  30.14 
 
 
574 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  29.04 
 
 
565 aa  225  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  30.69 
 
 
529 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.83 
 
 
577 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  29.06 
 
 
561 aa  218  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  31.19 
 
 
572 aa  217  4e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.62 
 
 
562 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.62 
 
 
590 aa  213  5.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  30.69 
 
 
573 aa  213  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  28.99 
 
 
541 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  29 
 
 
543 aa  210  5e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  28.44 
 
 
591 aa  210  7e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  28.27 
 
 
581 aa  206  9e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  29.07 
 
 
530 aa  206  9e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  27.32 
 
 
579 aa  205  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  28.04 
 
 
565 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  27.84 
 
 
586 aa  197  4.0000000000000005e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  29.54 
 
 
491 aa  197  5.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  29.05 
 
 
537 aa  196  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  29.25 
 
 
537 aa  195  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.15 
 
 
510 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  27.22 
 
 
580 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  27.99 
 
 
563 aa  194  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  27.99 
 
 
563 aa  194  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  27.45 
 
 
528 aa  188  3e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  28.63 
 
 
503 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  27.97 
 
 
535 aa  184  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  27.27 
 
 
540 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  26.82 
 
 
545 aa  172  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.72 
 
 
561 aa  172  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  29.6 
 
 
540 aa  171  3e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  26.54 
 
 
542 aa  171  4e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  27.19 
 
 
555 aa  167  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  25.96 
 
 
542 aa  164  5.0000000000000005e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  25.9 
 
 
535 aa  160  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  27.65 
 
 
546 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.82 
 
 
569 aa  150  7e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  54.74 
 
 
163 aa  148  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0563  Terminase  24.72 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126065  hitchhiker  0.00000000000223198 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  26 
 
 
556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0149  phage terminase, large subunit, putative  35.29 
 
 
229 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0123294  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  25.41 
 
 
455 aa  130  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3427  terminase large subunit, C-terminal region  27.05 
 
 
356 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  23.61 
 
 
534 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  26.9 
 
 
504 aa  110  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  36.18 
 
 
215 aa  109  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2689  Terminase  21.77 
 
 
629 aa  109  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1376  putative phage terminase, large subunit  21.37 
 
 
555 aa  106  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0389174 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  27.4 
 
 
551 aa  102  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0658  putative phage terminase, large subunit  21.6 
 
 
555 aa  101  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3592  terminase  21.57 
 
 
555 aa  101  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.156762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  21.46 
 
 
553 aa  97.8  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>