59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2153 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  73.27 
 
 		 551 aa  726    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2153  phage terminase  100 
 
 		 504 aa  1013    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.503371  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2633  phage terminase  71.77 
 
 		 544 aa  714    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  31.17 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  27.78 
 
 		 529 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2998  putative terminase large subunit  25.54 
 
 		 528 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.353099  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  26.2 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  26.9 
 
 		 558 aa  110  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  28.39 
 
 		 491 aa  102  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  25.54 
 
 		 581 aa  93.2  9e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  25.45 
 
 		 530 aa  90.1  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  24.9 
 
 		 581 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.85 
 
 		 537 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  26.5 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  25 
 
 		 535 aa  87  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  25.05 
 
 		 552 aa  86.7  9e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  24.46 
 
 		 537 aa  83.6  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  26.17 
 
 		 540 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  27.44 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.99 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  22.33 
 
 		 550 aa  80.9  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  23.77 
 
 		 535 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  26.21 
 
 		 540 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  24.9 
 
 		 535 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  23.35 
 
 		 521 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  24.08 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  22.49 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  24.46 
 
 		 561 aa  73.2  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  24.47 
 
 		 542 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  23.49 
 
 		 602 aa  69.7  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  24.05 
 
 		 569 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  25.43 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.05 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  21.85 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  21.46 
 
 		 602 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  24.31 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  23.18 
 
 		 534 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  23.68 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  22.99 
 
 		 534 aa  62  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  22.67 
 
 		 849 aa  62  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  22.52 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  22.97 
 
 		 571 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  21.44 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  23.42 
 
 		 579 aa  56.6  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  24.32 
 
 		 562 aa  55.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  27.08 
 
 		 569 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  22.22 
 
 		 581 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  24.07 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  22.17 
 
 		 557 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  24.07 
 
 		 562 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  22.83 
 
 		 562 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  22.83 
 
 		 562 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  25.52 
 
 		 569 aa  48.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.3 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.49 
 
 		 606 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  21.77 
 
 		 566 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  33.33 
 
 		 163 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  21.05 
 
 		 572 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  29.7 
 
 		 215 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>