96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5068 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  100 
 
 
566 aa  1137    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  99.47 
 
 
566 aa  1132    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  62.26 
 
 
573 aa  716    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  56.58 
 
 
562 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  55.65 
 
 
557 aa  591  1e-167  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  51.5 
 
 
552 aa  566  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  52.67 
 
 
553 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  52.27 
 
 
570 aa  561  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  52.49 
 
 
553 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  52.49 
 
 
553 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  51.77 
 
 
555 aa  552  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  52.31 
 
 
553 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  49.48 
 
 
580 aa  522  1e-147  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  48.76 
 
 
578 aa  505  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  41.25 
 
 
569 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  41.07 
 
 
569 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  43.81 
 
 
566 aa  393  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  38.42 
 
 
573 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  38.24 
 
 
573 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  40.28 
 
 
570 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.26 
 
 
562 aa  95.1  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.26 
 
 
590 aa  94.7  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.26 
 
 
591 aa  94  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.86 
 
 
541 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  24.09 
 
 
581 aa  90.1  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  23.45 
 
 
564 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  23.17 
 
 
573 aa  86.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  23.03 
 
 
543 aa  84.3  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  23.68 
 
 
557 aa  81.6  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  23.7 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  26.95 
 
 
546 aa  80.5  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  24.39 
 
 
552 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  23.41 
 
 
577 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  23.92 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  22.68 
 
 
574 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  24.16 
 
 
577 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  22.86 
 
 
574 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.56 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  21.86 
 
 
542 aa  73.9  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  23.09 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  22.58 
 
 
561 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  22.01 
 
 
545 aa  72  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.54 
 
 
535 aa  71.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.39 
 
 
521 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  24.25 
 
 
565 aa  68.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  21.24 
 
 
542 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  25 
 
 
561 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  19.72 
 
 
570 aa  67.8  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  20.33 
 
 
563 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  20.33 
 
 
563 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  21.89 
 
 
540 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  22.55 
 
 
585 aa  64.7  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  24.73 
 
 
586 aa  64.7  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  24.06 
 
 
562 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  24.06 
 
 
562 aa  64.3  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  22.24 
 
 
540 aa  63.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  23.17 
 
 
535 aa  62.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.23 
 
 
569 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  22.98 
 
 
580 aa  60.8  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  23.17 
 
 
561 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.81 
 
 
562 aa  60.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.81 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  19.6 
 
 
572 aa  59.7  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  21.75 
 
 
568 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.81 
 
 
562 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.41 
 
 
529 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  21.54 
 
 
581 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  23.55 
 
 
606 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.86 
 
 
535 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  21.79 
 
 
535 aa  56.6  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  23.58 
 
 
581 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  22.29 
 
 
491 aa  56.2  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  23.38 
 
 
606 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  21.48 
 
 
569 aa  55.1  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.06 
 
 
455 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  23.9 
 
 
550 aa  53.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  21.13 
 
 
534 aa  53.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  24.08 
 
 
558 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  23.69 
 
 
546 aa  52.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  21.13 
 
 
534 aa  52  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  20.76 
 
 
534 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  20.12 
 
 
571 aa  51.6  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  23.29 
 
 
537 aa  51.2  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  20.68 
 
 
590 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  20.68 
 
 
590 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  20.68 
 
 
590 aa  51.2  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  26.73 
 
 
510 aa  50.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  22.76 
 
 
556 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  21.68 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  22.77 
 
 
498 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  23.12 
 
 
581 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.29 
 
 
537 aa  49.7  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  25.34 
 
 
215 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0213  Phage terminase-like protein large subunit  25 
 
 
551 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  27.32 
 
 
602 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  23.88 
 
 
588 aa  43.9  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>