100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3946 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  60.41 
 
 		 553 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  60.28 
 
 		 570 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  60.41 
 
 		 553 aa  650    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  60.59 
 
 		 553 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  60.22 
 
 		 553 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  100 
 
 		 562 aa  1144    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  61.54 
 
 		 552 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  57.34 
 
 		 580 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  56.58 
 
 		 566 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  56.58 
 
 		 566 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  54.74 
 
 		 573 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  55.04 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  48.85 
 
 		 578 aa  494  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  44.46 
 
 		 569 aa  482  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  44.29 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  45.29 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  46.33 
 
 		 566 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  41.47 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  41.47 
 
 		 573 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  40.64 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  26.38 
 
 		 521 aa  108  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  24.67 
 
 		 530 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  23.82 
 
 		 541 aa  96.7  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  25.37 
 
 		 557 aa  93.6  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  24.85 
 
 		 556 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.49 
 
 		 562 aa  89.4  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.49 
 
 		 590 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  23.43 
 
 		 591 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  23.59 
 
 		 553 aa  86.7  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  23.73 
 
 		 540 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  23.9 
 
 		 535 aa  84.7  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  25.2 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.84 
 
 		 545 aa  82.8  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.18 
 
 		 543 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  23.11 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  23.11 
 
 		 563 aa  81.3  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  23.73 
 
 		 542 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  22.92 
 
 		 542 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.37 
 
 		 540 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  21.04 
 
 		 581 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  27.35 
 
 		 562 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  27.35 
 
 		 562 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  27.35 
 
 		 562 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  22.2 
 
 		 581 aa  76.3  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  21.86 
 
 		 534 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  20.66 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.5 
 
 		 565 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  23.56 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  21.35 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  21.35 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  21.35 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  22.65 
 
 		 571 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  22.75 
 
 		 535 aa  73.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  23.15 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  24.17 
 
 		 537 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  24.17 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  22.18 
 
 		 574 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  23.09 
 
 		 585 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  22.35 
 
 		 552 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  28.04 
 
 		 510 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  22.75 
 
 		 534 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  23.31 
 
 		 558 aa  68.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  20.37 
 
 		 570 aa  67.4  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  22.01 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  22.15 
 
 		 535 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  22.55 
 
 		 534 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  20.19 
 
 		 577 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  23.62 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  23.62 
 
 		 562 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  28.77 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  23.98 
 
 		 581 aa  64.7  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  20.97 
 
 		 564 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.85 
 
 		 529 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  22.43 
 
 		 849 aa  61.6  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  20.04 
 
 		 572 aa  62  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  22.67 
 
 		 568 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  23.17 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  23.34 
 
 		 561 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  18.84 
 
 		 574 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  24.42 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  24.37 
 
 		 581 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  22.1 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  20.81 
 
 		 580 aa  57.4  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  19.6 
 
 		 564 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  23.5 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2607  phage terminase  20.91 
 
 		 558 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  20.46 
 
 		 569 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  26.49 
 
 		 491 aa  55.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  21.26 
 
 		 565 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  21.04 
 
 		 573 aa  53.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  19.66 
 
 		 555 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  23.6 
 
 		 498 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.46 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.46 
 
 		 606 aa  50.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.22 
 
 		 546 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  20.57 
 
 		 455 aa  47.4  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2023  phage terminase  25 
 
 		 553 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  22.24 
 
 		 602 aa  47  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2059  phage terminase  25 
 
 		 553 aa  47  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2596  phage terminase  19.69 
 
 		 565 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>