102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_1538 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2239  phage terminase  65.39 
 
 
552 aa  718    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3946  terminase  60.59 
 
 
562 aa  655    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.087061  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0938  putative phage terminase, large subunit  98.19 
 
 
553 aa  1116    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1538  putative phage terminase, large subunit  100 
 
 
553 aa  1136    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2247  putative phage terminase, large subunit  99.82 
 
 
553 aa  1133    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000605357 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2893  putative phage terminase, large subunit  99.82 
 
 
553 aa  1133    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000134214 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3864  terminase  57.97 
 
 
570 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000385743 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1044  phage terminase, large subunit, putative  55.16 
 
 
580 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176224  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4081  Terminase  52.49 
 
 
566 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5068  Terminase  52.67 
 
 
566 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4116  phage terminase  53.72 
 
 
555 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.72688 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0238  phage terminase  48.51 
 
 
573 aa  534  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0646  phage terminase  46.86 
 
 
578 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0135346  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1603  Terminase  45.21 
 
 
557 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2070  putative Phage-related terminase  43.84 
 
 
569 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3315  phage terminase  43.48 
 
 
569 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1625  phage terminase  45.52 
 
 
566 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000276041  normal  0.989877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0359  phage terminase  41.24 
 
 
573 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0988  phage terminase  41.24 
 
 
573 aa  398  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1750  phage terminase  41.05 
 
 
570 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  22.38 
 
 
541 aa  99.4  2e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  22.8 
 
 
543 aa  98.2  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  20.61 
 
 
581 aa  92  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  23.74 
 
 
521 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  23.21 
 
 
535 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  24.64 
 
 
565 aa  90.1  9e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  24.38 
 
 
581 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1059  phage terminase  21.62 
 
 
563 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1079  phage terminase  21.62 
 
 
563 aa  90.1  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  22.54 
 
 
577 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.63 
 
 
562 aa  87.4  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  22.27 
 
 
530 aa  87.4  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.63 
 
 
590 aa  87  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  22.43 
 
 
564 aa  87  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  20.19 
 
 
577 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  24.09 
 
 
553 aa  85.9  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1455  Terminase  21.82 
 
 
572 aa  86.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1302  Terminase  24.28 
 
 
556 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  21.74 
 
 
573 aa  85.1  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  22.9 
 
 
591 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  21.94 
 
 
557 aa  85.1  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  21.16 
 
 
561 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  21.16 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.11 
 
 
545 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  24.08 
 
 
535 aa  82.4  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  23.69 
 
 
537 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  25.2 
 
 
585 aa  80.1  0.00000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0623  Terminase  21.04 
 
 
566 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  21 
 
 
574 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  23.32 
 
 
537 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  23.05 
 
 
535 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  22.31 
 
 
561 aa  78.2  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  22.37 
 
 
540 aa  77.4  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1722  phage terminase  22.96 
 
 
849 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.879362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1631  terminase  24.69 
 
 
586 aa  75.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0397  phage terminase, large subunit, putative  22.45 
 
 
534 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  21.17 
 
 
565 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2837  Terminase  22.24 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  28.78 
 
 
546 aa  72.4  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  21.98 
 
 
552 aa  71.2  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  23.31 
 
 
540 aa  71.2  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6182  phage terminase-like protein large subunit  22.04 
 
 
580 aa  69.7  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0535933  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  29.39 
 
 
510 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  19.96 
 
 
571 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2275  Terminase  20.04 
 
 
590 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1315  Terminase  20.04 
 
 
590 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1699  Terminase  20.04 
 
 
590 aa  67.8  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  22.07 
 
 
581 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0443  prophage LambdaBa04, terminase, large subunit  21.03 
 
 
562 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0465  prophage lambdaba04, terminase, large subunit  21.03 
 
 
562 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5155  phage terminase, large subunit  24.25 
 
 
498 aa  67  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  21.79 
 
 
542 aa  65.9  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  21.33 
 
 
556 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1251  phage terminase  22.11 
 
 
535 aa  65.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  21.79 
 
 
542 aa  63.9  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  22.54 
 
 
529 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  19.3 
 
 
564 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5836  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit, putative  20.41 
 
 
561 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  22.24 
 
 
602 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2960  Terminase  19.85 
 
 
555 aa  61.6  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3510  prophage LambdaBa01, terminase, large subunit  23.53 
 
 
562 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3787  prophage lambdaba01, terminase, large subunit  23.53 
 
 
562 aa  61.2  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.26855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  23.53 
 
 
562 aa  61.2  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5505  Terminase  20.59 
 
 
574 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  22.51 
 
 
568 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  23.41 
 
 
550 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1855  prophage LambdaSa2, terminase large subunit, putative  19.29 
 
 
570 aa  57.8  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.526141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2497  Terminase  24.55 
 
 
455 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0584  putative phage terminase, large subunit  20.98 
 
 
534 aa  54.3  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  22.66 
 
 
606 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  22.15 
 
 
606 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3429  terminase large subunit, N-terminal region  23.48 
 
 
215 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1587  putative phage terminase, large subunit  20.21 
 
 
579 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0773483  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0670  phage terminase  20.37 
 
 
569 aa  50.1  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  20.98 
 
 
558 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  21.25 
 
 
581 aa  47  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1768  phage terminase  30.89 
 
 
503 aa  46.2  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  24.24 
 
 
546 aa  45.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1616  phage terminase  23.12 
 
 
563 aa  44.7  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.332385  normal  0.451204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  21.3 
 
 
588 aa  44.3  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>