31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3612 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3612  Phage terminase-like protein protein large subunit-like protein  100 
 
 		 495 aa  1005    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.395024  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0872  Phage terminase-like protein  30.43 
 
 		 530 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0866597  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1726  phage terminase  26.22 
 
 		 540 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.18547  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  29.29 
 
 		 552 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  28 
 
 		 510 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3989  Terminase  29.14 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2020  phage terminase  28.99 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0333  phage terminase  28.99 
 
 		 542 aa  58.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4250  Terminase  26.33 
 
 		 557 aa  57.4  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1289  terminase  24.17 
 
 		 521 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0287  phage terminase  31.9 
 
 		 535 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3264  Terminase  30.87 
 
 		 546 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.727886  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2480  phage terminase  23.49 
 
 		 545 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0957  putative phage terminase, large subunit  24.6 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1616  phage terminase  30.94 
 
 		 537 aa  53.5  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.869159  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1472  phage terminase  31.16 
 
 		 537 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.528761  normal  0.245307 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1370  phage terminase  32.89 
 
 		 535 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1471  phage terminase, large subunit, putative  25.08 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1885  phage terminase  27.67 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.421412  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1088  terminase, large subunit, putative  22.37 
 
 		 535 aa  47.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0867  phage terminase, large subunit, putative  25.62 
 
 		 543 aa  46.2  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000215214  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  25.68 
 
 		 602 aa  45.8  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1642  phage terminase, large subunit, putative  21.2 
 
 		 529 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458906  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.74 
 
 		 489 aa  44.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2621  putative phage terminase, large subunit  23.19 
 
 		 564 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3431  terminase  22.02 
 
 		 562 aa  43.9  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511695  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  26.06 
 
 		 581 aa  43.9  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4094  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.22 
 
 		 562 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0654332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3806  prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.22 
 
 		 590 aa  43.5  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0560358  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  27.12 
 
 		 585 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2237  putative prophage LambdaBa02, terminase, large subunit  24.22 
 
 		 591 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0731538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>