10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5620 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5620  Terminase  100 
 
 		 537 aa  1101    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4221  Terminase  27.56 
 
 		 526 aa  153  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.329871  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0547  Phage terminase protein large subunit-like protein  26.01 
 
 		 574 aa  100  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1723  phage Terminase  26.07 
 
 		 587 aa  95.9  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2165  hypothetical protein  25.66 
 
 		 593 aa  79.3  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.122295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  23.61 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  23.61 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  23.59 
 
 		 489 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  23.96 
 
 		 489 aa  50.8  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0983  hypothetical protein  29.25 
 
 		 202 aa  45.8  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.597017 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>