10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0547 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0547  Phage terminase protein large subunit-like protein  100 
 
 		 574 aa  1184    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4221  Terminase  42.57 
 
 		 526 aa  377  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.329871  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2165  hypothetical protein  40.19 
 
 		 593 aa  359  8e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.122295 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1723  phage Terminase  29.36 
 
 		 587 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5620  Terminase  26.01 
 
 		 537 aa  100  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0983  hypothetical protein  28.57 
 
 		 202 aa  65.5  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.597017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  29.44 
 
 		 489 aa  57.4  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  27.68 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  27.68 
 
 		 489 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3106  hypothetical protein  33.33 
 
 		 228 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>