15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4221 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4221  Terminase  100 
 
 		 526 aa  1064    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.329871  normal  0.306119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0547  Phage terminase protein large subunit-like protein  42.57 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1723  phage Terminase  39.64 
 
 		 587 aa  346  6e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2165  hypothetical protein  37.57 
 
 		 593 aa  330  6e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.122295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5620  Terminase  27.56 
 
 		 537 aa  153  8e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3106  hypothetical protein  48.82 
 
 		 228 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0982  hypothetical protein  24.86 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.649062 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3074  phage terminase  27.23 
 
 		 489 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.218281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2914  phage terminase  27.78 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2958  phage terminase  27.78 
 
 		 489 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.911038 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0983  hypothetical protein  30.58 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.597017 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3893  Terminase  28.25 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  24.86 
 
 		 552 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1337  phage terminase  23.53 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2352  putative terminase large subunit / phage terminase  24.87 
 
 		 510 aa  43.9  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>