32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2261 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2261  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  260  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.051651  normal  0.80364 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1650  hypothetical protein  90.79 
 
 		 552 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1186  putative phage terminase, large subunit  35.4 
 
 		 585 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.619537  hitchhiker  0.0000000060413 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2063  phage terminase large subunit  47.14 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150685 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3397  terminase  46.48 
 
 		 581 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105114  hitchhiker  0.000000152047 
 
 
-
 
NC_008265  CPR_C0015  putative phage terminase, large subunit  38.67 
 
 		 581 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2967  phage terminase large subunit  35.29 
 
 		 581 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2596  Terminase  36.84 
 
 		 581 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.737156  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4005  putative phage terminase, large subunit  47.37 
 
 		 571 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1671  phage terminase  42.11 
 
 		 593 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2503  Terminase  36.26 
 
 		 602 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.052257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1679  phage terminase, large subunit, putative  38 
 
 		 574 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.606248  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7140  terminase  34.31 
 
 		 564 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2614  Terminase  44.93 
 
 		 606 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0870  phage terminase  36.36 
 
 		 556 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4281  Terminase  44.93 
 
 		 606 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3881  phage terminase, large subunit, putative  36.49 
 
 		 602 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00551839 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0464  phage terminase, large subunit  37.31 
 
 		 581 aa  48.5  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.281704 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7332  Terminase  35.35 
 
 		 581 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.959431  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4462  putative phage terminase, large subunit  36.92 
 
 		 558 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365476 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4385  putative phage terminase, large subunit  34.72 
 
 		 565 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0645  phage terminase  33.67 
 
 		 583 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.709389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3973  phage terminase  30.21 
 
 		 568 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.230918 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1967  Phage terminase protein  33.94 
 
 		 604 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1658  Terminase  35.9 
 
 		 565 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2471  Terminase  34.92 
 
 		 550 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1545  phage terminase  50 
 
 		 588 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.512611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1335  terminase  26.45 
 
 		 569 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.21157 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2267  putative phage terminase, large subunit  30.56 
 
 		 577 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2602  phage terminase  30.56 
 
 		 573 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1563  phage terminase, large subunit, putative  27.19 
 
 		 561 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.446284  hitchhiker  0.000374969 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2271  putative phage terminase, large subunit  28.7 
 
 		 577 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.441488  hitchhiker  0.000000000000278373 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>