More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1420 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 179 aa  363  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  77.71 
 
 		 174 aa  281  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  37.65 
 
 		 131 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  36.59 
 
 		 133 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  34.18 
 
 		 125 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  35.98 
 
 		 1077 aa  98.6  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  35.03 
 
 		 122 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  35.67 
 
 		 126 aa  95.5  4e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  36.75 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.44 
 
 		 122 aa  94.4  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  39.16 
 
 		 142 aa  91.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  34.39 
 
 		 120 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 		 125 aa  88.6  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  36.42 
 
 		 130 aa  87.4  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  32.5 
 
 		 130 aa  86.3  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  34.81 
 
 		 122 aa  86.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  34.69 
 
 		 1418 aa  84.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  32.48 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  32.03 
 
 		 284 aa  81.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.25 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  32.69 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  28.74 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  33.58 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 		 121 aa  73.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  28.67 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  56.36 
 
 		 1348 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 149 aa  72  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  30.2 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 109 aa  68.9  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  26.57 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  26.01 
 
 		 139 aa  67.4  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  30.22 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  26.21 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  24.84 
 
 		 289 aa  64.7  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  27.04 
 
 		 139 aa  62  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  32.87 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  32.21 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  30.13 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  27.63 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  27.46 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  27.27 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  24.46 
 
 		 130 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  28.78 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  27.03 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  30.34 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1996  HIT family protein  26.12 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  23.02 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  27.66 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  29.03 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  23.02 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2281  HIT family protein  30.88 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  29.58 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 		 137 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  26.43 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  21.58 
 
 		 130 aa  57  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  27.2 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  23.4 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  26.9 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  28.87 
 
 		 167 aa  57  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  21.48 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  30.07 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  28.87 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  32.19 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  30.94 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  22.14 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  30.94 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  30.94 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1225  histidine triad (HIT) protein  25.32 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1725  histidine triad (HIT) protein  28.48 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  25.52 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  27.14 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  26.76 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  28.06 
 
 		 148 aa  55.8  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  25.52 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  25.52 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  21.83 
 
 		 131 aa  55.5  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  33.1 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  26.24 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  25.74 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0312  histidine triad (HIT) protein  25.38 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0762523  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  34.94 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  24.46 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  25.9 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12750  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 114 aa  54.7  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.28931  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  29.01 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  23.4 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0455  HIT domain-containing protein  29.32 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.378719  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14523  predicted protein  30.4 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  26.03 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  26.28 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  26.21 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  26.28 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1190  histidine triad (HIT) protein  24.26 
 
 		 114 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.225426  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  26.28 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 136 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>