More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1000 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  100 
 
 		 122 aa  255  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  66.95 
 
 		 120 aa  170  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  61.67 
 
 		 126 aa  161  3e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  60 
 
 		 122 aa  156  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  58.47 
 
 		 124 aa  154  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  57.98 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  55.83 
 
 		 122 aa  148  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  55.56 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  55.65 
 
 		 130 aa  136  7.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  56.64 
 
 		 1418 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  54.92 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  50.82 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  55.74 
 
 		 133 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  53.23 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  51.67 
 
 		 125 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  44.72 
 
 		 1077 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  64.13 
 
 		 109 aa  121  4e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 284 aa  115  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  49.18 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.44 
 
 		 126 aa  113  6.9999999999999995e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  49.11 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  45.3 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  47.75 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  40.16 
 
 		 289 aa  105  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 		 289 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  58.9 
 
 		 1348 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  33.54 
 
 		 174 aa  89.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 		 179 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  41.13 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0648  histidine triad (HIT) protein  41.09 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  42.68 
 
 		 181 aa  77  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1657  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.411198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  30.91 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  36.94 
 
 		 165 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2090  histidine triad (HIT) protein  34.4 
 
 		 182 aa  73.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.746736  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0620  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00610052  hitchhiker  0.000000200539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  32.99 
 
 		 137 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1638  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 162 aa  72  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000357011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2290  histidine triad (HIT) protein  37.17 
 
 		 164 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0845631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0562  histidine triad (HIT) protein  38.55 
 
 		 167 aa  72.4  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13910  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.4 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0128023  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1980  histidine triad (HIT) protein  46.84 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  33.07 
 
 		 165 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  37.36 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0551  histidine triad (HIT) protein  31.86 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12632  hypothetical protein  34.31 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0100073  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1701  HIT family protein  33.33 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.652784  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0357  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 298 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0469904 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2713  histidine triad (HIT) protein  29.92 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.256067  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  32.26 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1360  histidine triad (HIT) protein  32.8 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.529345 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  34.82 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  36.61 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2433  histidine triad (HIT) protein  36.94 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106121  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  31.53 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2559  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  33.67 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2042  histidine triad (HIT) protein  35.14 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000192809 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2064  histidine triad (HIT) protein  43.88 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.225025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  30.28 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  32.73 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2335  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3187  histidine triad (HIT) protein  35.25 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2345  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1325  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0365255  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2243  histidine triad (HIT) protein  35.63 
 
 		 220 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.118301  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  28.83 
 
 		 164 aa  67.4  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2282  histidine triad (HIT) protein  32.98 
 
 		 244 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.983913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  32.43 
 
 		 166 aa  67.4  0.00000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2290  histidine triad (HIT) protein  32.98 
 
 		 244 aa  67  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.358271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1387  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 171 aa  67  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.026049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1522  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 165 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.311815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1305  histidine triad (HIT) protein  28.46 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0449  diadenosine tetraphosphate hydrolase  33.93 
 
 		 194 aa  67  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1183  histidine triad (HIT) protein  35.45 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.970277  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  33.65 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  33.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  33.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  33.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  33.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  33.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  32.14 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  33.98 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  33.98 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  29.25 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  33.65 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1357  histidine triad (HIT) protein  33.64 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.474283 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  36.28 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>