More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_07720 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_07720  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3984  type III restriction protein res subunit  55 
 
 
1418 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0142  histidine triad (HIT) protein  52.29 
 
 
130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0651  histidine triad (HIT) protein  50.94 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0007662  unclonable  0.000000000136009 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0450  hypothetical protein  50 
 
 
124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1000  hypothetical protein  49.11 
 
 
122 aa  113  7.999999999999999e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1576  putative hydrolase  47.15 
 
 
182 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.031095  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1659  histidine triad (HIT) protein  50.46 
 
 
125 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.490499  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1004  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
125 aa  110  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4565  histidine triad (HIT) protein  46.4 
 
 
130 aa  110  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1438  type III restriction enzyme, res subunit  43.2 
 
 
1077 aa  108  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.977948  hitchhiker  0.0058487 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2227  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.17 
 
 
122 aa  107  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4872  histidine triad (HIT) protein  42.64 
 
 
133 aa  107  6e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0365  histidine triad (HIT) protein  46.85 
 
 
121 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.5377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0432  histidine triad (HIT) protein  43.9 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1435  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
126 aa  105  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.657133  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1209  histidine triad (HIT) protein  42.62 
 
 
131 aa  105  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.818472  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1483  hypothetical protein  50.98 
 
 
142 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4049  histidine triad (HIT) protein  40.83 
 
 
289 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
284 aa  94.7  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0929  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  42.57 
 
 
126 aa  90.9  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.685079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0296  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.37 
 
 
127 aa  90.5  7e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1488  histidine triad (HIT) protein  53.49 
 
 
109 aa  88.6  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000559646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4113  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
289 aa  82  0.000000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3993  type III restriction protein res subunit  55.38 
 
 
1348 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0920  histidine triad (HIT) protein  35.88 
 
 
174 aa  74.7  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.675581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1420  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 
179 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  36.45 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.9 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1342  histidine triad (HIT) protein  38.37 
 
 
163 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.187699  normal  0.535938 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0010  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0387329  normal  0.117285 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0839  histidine triad (HIT) protein  34.23 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0818988  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  41.12 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  39.08 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  39.08 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0629  Hit family protein  35.63 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0077  histidine triad (HIT) protein  41.41 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2064  histidine triad (HIT) protein  43.33 
 
 
164 aa  67  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.225025 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0927  HIT family hydrolase  38.14 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  34.26 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  33.01 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1658  histidine triad (HIT) protein  36.47 
 
 
164 aa  65.5  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2525  histidine triad (HIT) protein  36.78 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.271713  normal  0.184582 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  35.56 
 
 
141 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1973  HIT family protein  38.82 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000182824  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1524  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1462  histidine triad (HIT) protein  37.21 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2598  histidine triad (HIT) protein  30.56 
 
 
169 aa  63.9  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1878  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 
172 aa  63.9  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0187  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.414611  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0837  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
143 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1932  histidine triad (HIT) protein  38.37 
 
 
178 aa  63.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.106566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  34.44 
 
 
140 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1553  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 
177 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.906837  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  36.9 
 
 
130 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1504  HIT (HINT, histidine triad) family protein  32.41 
 
 
165 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000163027  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  32.71 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.311796 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  30.23 
 
 
139 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  39.76 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1390  protein kinase C inhibitor  37.8 
 
 
114 aa  61.6  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000527818  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10458  predicted protein  35.29 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2372  histidine triad (HIT) protein  30.71 
 
 
174 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3837  histidine triad (HIT) protein  28.83 
 
 
182 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.868089  normal  0.143653 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0143  histidine triad domain-containing protein  37.93 
 
 
161 aa  61.2  0.000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1920  histidine triad (HIT) protein  31.19 
 
 
182 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.629691  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2288  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
193 aa  60.8  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.274965  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  40.48 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2074  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
165 aa  60.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165381  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0956  histidine triad (HIT) protein  31.03 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.630864  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0074  histidine triad (HIT) protein  37.63 
 
 
180 aa  60.5  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1324  Hit family protein  34.09 
 
 
165 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 
131 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 
144 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2944  histidine triad (HIT) protein  35.35 
 
 
179 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.173088  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1434  histidine triad (HIT) protein  38.82 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186815  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  34.62 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  34.62 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>