More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2848 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 136 aa  281  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  51.97 
 
 		 139 aa  140  6e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  46.77 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  49.62 
 
 		 139 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  42.65 
 
 		 144 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.84 
 
 		 132 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  41.61 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  41.61 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  41.61 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  41.61 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  41.61 
 
 		 165 aa  116  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  41.61 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  41.61 
 
 		 144 aa  116  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  40.46 
 
 		 142 aa  115  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  41.61 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 143 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 137 aa  114  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  43.1 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  40.46 
 
 		 138 aa  114  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  40.6 
 
 		 133 aa  113  7.999999999999999e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  40.88 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  40.88 
 
 		 144 aa  113  7.999999999999999e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  43.12 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  41.8 
 
 		 143 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  37.23 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  43.52 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  41.53 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  40.87 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  42.02 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  40 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  41.03 
 
 		 141 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  42.98 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 139 aa  98.2  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  38.58 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  41.75 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  37.68 
 
 		 156 aa  95.1  3e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  41.75 
 
 		 140 aa  94.7  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 130 aa  94.7  4e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 142 aa  94  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  42.11 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2038  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000923798  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 		 143 aa  92.8  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  36.29 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 142 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 		 145 aa  92  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  33.33 
 
 		 131 aa  92  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 145 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  38.13 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 142 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.74 
 
 		 144 aa  90.5  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  38.71 
 
 		 142 aa  90.1  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  39.45 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  40.71 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 144 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 		 114 aa  89  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 		 139 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  36.79 
 
 		 139 aa  87.8  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  40.2 
 
 		 117 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  40.38 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  37.86 
 
 		 140 aa  88.2  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  38.06 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  40.95 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  40.95 
 
 		 138 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>