More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1561 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 139 aa  289  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  79.86 
 
 		 139 aa  246  8e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  54.81 
 
 		 138 aa  173  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  49.62 
 
 		 136 aa  135  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  44.12 
 
 		 139 aa  127  7.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  45.9 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  43.17 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 		 140 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  44.62 
 
 		 135 aa  116  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  45.19 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  35.92 
 
 		 165 aa  115  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  35.92 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  35.92 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  35.92 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  35.92 
 
 		 144 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  35.92 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  35.92 
 
 		 144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  36.62 
 
 		 144 aa  114  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  35.21 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  35.21 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  43.94 
 
 		 138 aa  111  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  41.82 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  40.3 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  49.06 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  42.4 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  48.11 
 
 		 142 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  50.49 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  43.52 
 
 		 141 aa  104  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  38.69 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  38.64 
 
 		 143 aa  103  5e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  37.96 
 
 		 145 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  34.53 
 
 		 138 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  38.24 
 
 		 133 aa  103  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  36.62 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  38.33 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  36.72 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  41.51 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  40.57 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  44.76 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 151 aa  100  8e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  45.22 
 
 		 145 aa  100  8e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.72 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  43.4 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  44.23 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  45.28 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 		 130 aa  99  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 		 145 aa  99  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  43.69 
 
 		 139 aa  97.8  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 143 aa  97.1  8e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  42.19 
 
 		 149 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  36.43 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  42.37 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  40.29 
 
 		 148 aa  96.3  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  43.93 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  42.45 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 		 130 aa  96.7  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  37.21 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  37.59 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.5 
 
 		 144 aa  95.9  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  37.5 
 
 		 144 aa  95.1  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  37.38 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.78 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.5 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  34.62 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  36.43 
 
 		 144 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  39.62 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 		 145 aa  91.3  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 139 aa  90.5  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 143 aa  90.1  8e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>