More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2237 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
138 aa  287  4e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  54.07 
 
 
139 aa  177  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  54.81 
 
 
139 aa  173  6e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  46.77 
 
 
136 aa  135  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  45.65 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  49.11 
 
 
139 aa  117  7e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  39.29 
 
 
140 aa  114  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  38.3 
 
 
140 aa  113  8.999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.6 
 
 
132 aa  111  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  37.68 
 
 
165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  37.41 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  37.41 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  37.41 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  37.41 
 
 
144 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 
148 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  37.68 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  37.68 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.73 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  41.91 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.59 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  43.75 
 
 
133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  37.23 
 
 
141 aa  107  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  36.96 
 
 
144 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  37.86 
 
 
139 aa  107  6e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  36.96 
 
 
144 aa  107  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  43.7 
 
 
142 aa  107  7.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  36.69 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 
130 aa  106  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  40.15 
 
 
139 aa  105  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  42.96 
 
 
146 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  44.95 
 
 
140 aa  103  8e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  40.98 
 
 
140 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
130 aa  102  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 
138 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  40.98 
 
 
140 aa  102  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 
140 aa  102  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
139 aa  102  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
149 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  39.13 
 
 
139 aa  101  3e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 
131 aa  101  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
139 aa  101  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
142 aa  100  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
138 aa  100  5e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  40.77 
 
 
135 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  42.75 
 
 
142 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 
137 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  38.69 
 
 
149 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
144 aa  100  7e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  38.74 
 
 
130 aa  100  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
140 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 
130 aa  99.4  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  42.73 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  40.44 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  41.88 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.52 
 
 
140 aa  98.2  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  46.36 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 
151 aa  95.9  1e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  43.64 
 
 
145 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  42.06 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.96 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 
145 aa  94.4  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.96 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  41.91 
 
 
149 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  39.02 
 
 
156 aa  91.7  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  45.37 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 
141 aa  92  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
140 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  41.73 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  42.86 
 
 
142 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 
145 aa  90.1  8e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 
139 aa  90.1  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
140 aa  89  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3376  histidine triad (HIT) protein  41.75 
 
 
116 aa  87.8  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 
144 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  41.12 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 
137 aa  87.4  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  40.91 
 
 
148 aa  87  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  35.51 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  33.59 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  36.76 
 
 
143 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  37.4 
 
 
139 aa  85.1  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  42.59 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>