More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0004 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 149 aa  308  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  73.79 
 
 		 146 aa  235  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  73.1 
 
 		 145 aa  224  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  73.24 
 
 		 143 aa  220  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  55.63 
 
 		 149 aa  156  8e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  44.53 
 
 		 144 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  43.8 
 
 		 140 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  45.38 
 
 		 165 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  43.07 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  43.07 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  43.07 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  43.07 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  43.07 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  43.07 
 
 		 144 aa  130  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  42.34 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  42.34 
 
 		 144 aa  127  5.0000000000000004e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 		 143 aa  127  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  42.34 
 
 		 144 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  41.41 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  43.48 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  48.87 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  37.78 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  48.89 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  51.92 
 
 		 145 aa  110  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  45.54 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 		 139 aa  108  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  46.49 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.03 
 
 		 132 aa  107  5e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  46.62 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  40.17 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  44.83 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  51.4 
 
 		 144 aa  102  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  38.85 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  38.35 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 		 138 aa  102  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  38.97 
 
 		 140 aa  102  3e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 		 146 aa  101  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  45.74 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  41.59 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  47 
 
 		 146 aa  100  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  41.35 
 
 		 139 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  46 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 143 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  40.95 
 
 		 151 aa  99  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 		 142 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 		 143 aa  98.2  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  38.73 
 
 		 142 aa  97.8  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  37.21 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  44.44 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 		 143 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 142 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  38.52 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.52 
 
 		 140 aa  95.9  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 		 142 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  33.58 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 301 aa  94.4  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  46.08 
 
 		 141 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  32.84 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  36.75 
 
 		 139 aa  93.6  8e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  40.77 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  44.74 
 
 		 114 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  38.36 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  41.27 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.81 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  40.16 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  39.71 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  39.66 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  39.02 
 
 		 144 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 139 aa  90.9  6e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  38.6 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 		 148 aa  90.1  9e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  40.48 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  44.66 
 
 		 143 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 142 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 		 145 aa  89.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  39.72 
 
 		 142 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  36.36 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  41.27 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 136 aa  87.8  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35.11 
 
 		 130 aa  87.4  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 		 144 aa  87  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  37.41 
 
 		 149 aa  87  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>