More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0211 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
145 aa  296  9e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  78.57 
 
 
145 aa  231  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  66.67 
 
 
144 aa  195  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  63.97 
 
 
144 aa  180  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  60.15 
 
 
141 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  60.15 
 
 
141 aa  169  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  59.42 
 
 
139 aa  166  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4823  histidine triad (HIT) protein  61.94 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.784878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5415  histidine triad (HIT) protein  61.94 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  61.94 
 
 
139 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.311796 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0206  histidine triad (HIT) protein  60.45 
 
 
143 aa  159  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  62.12 
 
 
139 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  62.12 
 
 
139 aa  157  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  58.09 
 
 
138 aa  156  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  56.62 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  56.62 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  56.62 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  56.62 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  56.62 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  56.62 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  56.62 
 
 
139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  54.35 
 
 
142 aa  153  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  50.71 
 
 
145 aa  151  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  52.21 
 
 
139 aa  150  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  51.06 
 
 
141 aa  150  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
140 aa  146  8e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  48.57 
 
 
140 aa  145  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  54.41 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  48.57 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  52.55 
 
 
139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  49.64 
 
 
143 aa  144  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
145 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  51.88 
 
 
145 aa  141  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  47.83 
 
 
142 aa  140  7e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  47.52 
 
 
145 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  48.57 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  49.26 
 
 
142 aa  137  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  47.1 
 
 
142 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  47.79 
 
 
142 aa  137  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  49.26 
 
 
140 aa  136  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  48.23 
 
 
143 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  49.26 
 
 
142 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  43.57 
 
 
140 aa  135  2e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4665  histidine triad (HIT) protein  55.47 
 
 
146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394805  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  47.66 
 
 
141 aa  133  9e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
145 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  44.12 
 
 
142 aa  130  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  47.06 
 
 
145 aa  130  6e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1532  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  0.453293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  46.09 
 
 
142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1666  histidine triad (HIT) protein  47.45 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.225024  normal  0.108561 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  46.21 
 
 
139 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  43.94 
 
 
145 aa  123  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  45.99 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  45.99 
 
 
146 aa  121  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4754  hypothetical protein  47.06 
 
 
141 aa  121  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.419636  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  47.54 
 
 
143 aa  120  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  45.26 
 
 
144 aa  117  7.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  47.41 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  43.17 
 
 
145 aa  114  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  48.12 
 
 
142 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  45.86 
 
 
146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  46.21 
 
 
145 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  46.21 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
137 aa  104  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  48.08 
 
 
135 aa  104  5e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  45.71 
 
 
143 aa  102  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
140 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  46.67 
 
 
140 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  45.71 
 
 
141 aa  101  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  43.81 
 
 
144 aa  101  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  43.27 
 
 
137 aa  100  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  46.67 
 
 
139 aa  100  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  47.12 
 
 
149 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  44.55 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  42.31 
 
 
165 aa  97.8  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  48.04 
 
 
140 aa  97.8  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  42.31 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  42.31 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  42.31 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  42.31 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  42.31 
 
 
144 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  42.31 
 
 
144 aa  97.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  43.52 
 
 
149 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
144 aa  96.7  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.64 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  41.35 
 
 
144 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  41.35 
 
 
144 aa  94  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  44.25 
 
 
139 aa  94  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  35.29 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.31 
 
 
139 aa  91.3  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  42.31 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 
136 aa  88.2  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.2 
 
 
132 aa  87.8  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 
455 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  38.39 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  36.44 
 
 
138 aa  84.3  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  40.2 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>