More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2454 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
145 aa  293  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
143 aa  289  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  74.48 
 
 
146 aa  228  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  73.1 
 
 
149 aa  224  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  48.59 
 
 
149 aa  131  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  42.75 
 
 
139 aa  121  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  44.07 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  44.07 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  44.07 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  44.07 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  44.07 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  47.14 
 
 
144 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  44.07 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  44.07 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  44.07 
 
 
144 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  43.22 
 
 
144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
140 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  45.11 
 
 
138 aa  116  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  43.22 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  48.48 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  43.22 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  48.67 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  40.58 
 
 
139 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  40 
 
 
139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  45.11 
 
 
142 aa  114  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  41.23 
 
 
138 aa  114  5e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 
140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  41.94 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  41.46 
 
 
136 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  48.89 
 
 
142 aa  110  6e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  49.63 
 
 
145 aa  110  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  38.33 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 
139 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  48.15 
 
 
142 aa  107  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  50.89 
 
 
144 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
141 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
142 aa  105  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  42.96 
 
 
140 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  41.79 
 
 
140 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  41.79 
 
 
140 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  42.25 
 
 
143 aa  103  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
149 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  46.21 
 
 
145 aa  103  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  38.97 
 
 
140 aa  102  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  40.6 
 
 
139 aa  102  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  42.07 
 
 
146 aa  100  5e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 
135 aa  100  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  43.12 
 
 
140 aa  100  6e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  46.73 
 
 
146 aa  100  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0952  histidine triad (HIT) protein  48 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117681  hitchhiker  0.00115812 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  37.31 
 
 
133 aa  98.2  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  43.66 
 
 
139 aa  98.2  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  40.74 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  47.47 
 
 
145 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  42.03 
 
 
143 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  45.79 
 
 
146 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  42.42 
 
 
142 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  38.39 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  40.68 
 
 
144 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  45.63 
 
 
141 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 
137 aa  95.9  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  40.28 
 
 
145 aa  95.9  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  44.86 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  38.57 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  40.52 
 
 
138 aa  94.4  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  40.37 
 
 
144 aa  94  7e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  41.79 
 
 
139 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1499  histidine triad (HIT) protein  39.13 
 
 
301 aa  92.4  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.348624  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  41.43 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  42.03 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  44.76 
 
 
139 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  38.3 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  39.01 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  38.78 
 
 
149 aa  90.5  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  44.76 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  37.5 
 
 
140 aa  90.1  8e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  39.5 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  40.32 
 
 
142 aa  90.1  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2542  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
174 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.82 
 
 
139 aa  89.7  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  43.18 
 
 
144 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  39.82 
 
 
140 aa  89  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 
142 aa  89  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
151 aa  88.6  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  44.04 
 
 
148 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4665  histidine triad (HIT) protein  45.19 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>