More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1284 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  70.9 
 
 		 149 aa  188  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  62.77 
 
 		 140 aa  171  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  64.44 
 
 		 140 aa  169  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  57.46 
 
 		 148 aa  156  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  56.93 
 
 		 142 aa  155  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  52.59 
 
 		 144 aa  146  8e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  46.83 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.88 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  43.88 
 
 		 145 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  49.09 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  42.66 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  42.66 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  42.66 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  42.37 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 136 aa  94.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 139 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1616  histidine triad (HIT) protein  43.51 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  41.86 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  35.25 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  37.12 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 		 146 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  38.71 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 		 143 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  38.81 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  38.26 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  34.56 
 
 		 139 aa  86.7  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.58 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  34.78 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  41.67 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  37.31 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  41.44 
 
 		 143 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  44.64 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  31.85 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  39.39 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.82 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.31 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  38.52 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  40.35 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  42.99 
 
 		 153 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  37.88 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 143 aa  78.2  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  39.09 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  30.22 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  36.69 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  37.72 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 		 142 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  38.98 
 
 		 114 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  36.3 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  36.69 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  39.39 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  38.94 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  28.33 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  34.48 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.36 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  36.69 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  34.53 
 
 		 141 aa  73.6  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  32.76 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1852  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 		 114 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.279518 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  35.97 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  36.67 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  30.34 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  34.29 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  33.59 
 
 		 455 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  38.84 
 
 		 114 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  34.06 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0531  histidine triad (HIT) protein  39.62 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.406416  normal  0.0183035 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04560  histidine triad (HIT) protein  30.4 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  30.6 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3348  histidine triad  33.56 
 
 		 157 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  35.48 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  34.75 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  30.47 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0612  HIT family protein  30.65 
 
 		 145 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000194995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  31.9 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1065  histidine triad (HIT) protein  32.76 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  44.59 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>