More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2683 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 149 aa  304  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  42.98 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  38.46 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  37.84 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  29.2 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  27.97 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 129 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  44.66 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  33.86 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46060  histidine triad (HIT) family protein  46.3 
 
 		 112 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  29.32 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  39.18 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  36.7 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  36.79 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  32.69 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  36.79 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  36.79 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  35 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  36.79 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  33.94 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  31.43 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  33.33 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  32.21 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  37.74 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  34 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  40.19 
 
 		 148 aa  78.2  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  37.14 
 
 		 151 aa  78.2  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.5 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  27.82 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  31.07 
 
 		 129 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  36.28 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  40 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  33.05 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2991  histidine triad (HIT) protein  37.25 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337185  normal  0.959668 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  40.2 
 
 		 149 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0797  putative HIT family protein  43.52 
 
 		 112 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  32.74 
 
 		 132 aa  74.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1705  HIT family protein  42.31 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08420  putative HIT family protein  43.52 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000152686 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 140 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  37.86 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  37.11 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  36.52 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  39.05 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  33 
 
 		 131 aa  73.6  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0865  histidine triad domain protein  40.38 
 
 		 120 aa  73.2  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  31.37 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0338  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 121 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.288049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  37.86 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0432  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0312734  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0597  diadenosine tetraphosphate hydrolase  40.57 
 
 		 112 aa  72.8  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  36.11 
 
 		 143 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0774  HIT family protein  32.76 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000367298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0353  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0612  HIT family protein  30.66 
 
 		 145 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000194995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0645  HIT family protein  30.66 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000710246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4657  HIT family protein  36 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000190744  hitchhiker  3.0087100000000003e-24 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0362  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.481847 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0414  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00547483 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0180  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1941  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 114 aa  70.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00748387  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2672  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.429078  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0435  histidine triad (HIT) protein  38.32 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46824  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1730  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.020903 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0557  hydrolase HIT family  29.93 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000022236  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  33.66 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  31.13 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3159  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 117 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000807551 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3656  HIT family protein  37.38 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2755  HIT family protein  37.38 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>