More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1632 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  100 
 
 		 130 aa  255  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  55.91 
 
 		 132 aa  157  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  58.46 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  57.26 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  55.2 
 
 		 129 aa  152  2e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  54.62 
 
 		 129 aa  148  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  55.12 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  50.79 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  55.91 
 
 		 130 aa  133  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  45.38 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  38.02 
 
 		 133 aa  104  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  38.46 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  36.72 
 
 		 133 aa  100  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  37.69 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 148 aa  97.8  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 		 134 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 136 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  34.86 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 142 aa  87.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  29.23 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  28.46 
 
 		 146 aa  83.6  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 		 142 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  33.59 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  32.09 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  33.61 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  33.61 
 
 		 138 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.43 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  34.53 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  31.06 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 138 aa  72.4  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  34.38 
 
 		 144 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  30.37 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 141 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  38.83 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.83 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 		 138 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 		 146 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  38.83 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  38.83 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  40 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  32.03 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  32.43 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  32.43 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  32.43 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  29.55 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  32.43 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  30.15 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.51 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.86 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  37 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  31.3 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  30.3 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  37 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  28.81 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2210  histidine triad (HIT) protein  37.39 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.544525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  29.66 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  37.62 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 143 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  38.18 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  39.6 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 148 aa  62  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1120  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  34.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  33.02 
 
 		 141 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0560  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0600  HIT family protein  39.62 
 
 		 112 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.66 
 
 		 140 aa  62  0.000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  29.93 
 
 		 151 aa  62  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  30.15 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>