More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0826 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 141 aa  286  9e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  62.31 
 
 		 133 aa  169  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  55.4 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  53.08 
 
 		 138 aa  149  8.999999999999999e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  52.31 
 
 		 134 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  52.24 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  52.24 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  52.24 
 
 		 138 aa  148  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  52.34 
 
 		 133 aa  144  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  49.29 
 
 		 148 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.57 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  45 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 131 aa  130  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 		 136 aa  117  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  43.94 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  43.94 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  41.22 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  40 
 
 		 129 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  40.62 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 129 aa  99  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  33.85 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  38.28 
 
 		 128 aa  97.1  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  33.86 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  42.31 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  39.13 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  36.57 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 		 143 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  31.25 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 139 aa  77.4  0.00000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  33.58 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  33.88 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  34.81 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  35.92 
 
 		 149 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.33 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  33.86 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 145 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  33.33 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  31.88 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 		 148 aa  68.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  25.21 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  36.63 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 136 aa  67.8  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  26.56 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  35.64 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  35.92 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  36.19 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  30.66 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  31.34 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  31.39 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  26.72 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1102  hypothetical protein  27.2 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.545015 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  31.88 
 
 		 142 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  33.02 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2566  histidine triad (HIT) protein  39.22 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1911  hypothetical protein  34.34 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0579038  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  31.43 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  27.62 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  29.75 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  32.54 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  28.36 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  34.19 
 
 		 139 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3139  histidine triad (HIT) protein  35.77 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0448341 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  30.43 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  34 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  31.62 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  39.45 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1373  HIT family protein  31.68 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00295303  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  30.43 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  30.66 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 		 141 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  32.73 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1012  histidine triad (HIT) protein  36.27 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>