More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2413 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
148 aa  290  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  56.12 
 
 
146 aa  150  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  50.71 
 
 
142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  52.99 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  49.29 
 
 
141 aa  144  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  50.7 
 
 
142 aa  141  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  54.62 
 
 
131 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  46.27 
 
 
138 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  46.27 
 
 
138 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  46.27 
 
 
138 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 
134 aa  126  8.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  45.38 
 
 
133 aa  126  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  44.62 
 
 
138 aa  120  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  42.97 
 
 
133 aa  117  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 
136 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  50 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  45.04 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  45.04 
 
 
131 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  33.08 
 
 
130 aa  97.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  36.72 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  33.85 
 
 
129 aa  95.1  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  31.54 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 
128 aa  92.4  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 
131 aa  86.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  34.69 
 
 
129 aa  82.4  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  36.92 
 
 
130 aa  82  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
145 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  36.84 
 
 
143 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  29.92 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
139 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 
129 aa  76.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 
146 aa  75.5  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  33.85 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  34.91 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  33.8 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  35.29 
 
 
107 aa  73.2  0.000000000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  29.86 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  39.42 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  24.22 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  32.59 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  24.22 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  25 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  24.22 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  34.09 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  28.21 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  29.41 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  31.43 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  30.83 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  35.29 
 
 
133 aa  68.2  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  36.04 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  30.15 
 
 
142 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  30.83 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  35.04 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  32.81 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  30.83 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  30.6 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  35.66 
 
 
139 aa  67  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  31.85 
 
 
143 aa  66.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  38.06 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 
141 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  33.98 
 
 
139 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  30.66 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  30.37 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  31.13 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  31.13 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  31.13 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  31.13 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  31.13 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  30.84 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  30.84 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  32.23 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  32.84 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
455 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  33.8 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 
141 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  29.1 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  31.01 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  28.45 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  27.21 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  33.01 
 
 
151 aa  63.2  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  34.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  34.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  28.47 
 
 
142 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  34.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  34.33 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  30.19 
 
 
144 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  34.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0238  HIT family protein  34.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5333  histidine triad (HIT) protein  35.66 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  34.33 
 
 
138 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4791  histidine triad (HIT) protein  35.66 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  34.67 
 
 
145 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  29.85 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 
146 aa  62.4  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>