More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3102 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 		 131 aa  258  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  74.05 
 
 		 136 aa  204  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  54.62 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  49.23 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  49.23 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  48.46 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  49.22 
 
 		 133 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  50.77 
 
 		 143 aa  130  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  53.85 
 
 		 141 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  46.92 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  50.38 
 
 		 133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  48.85 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  48.46 
 
 		 142 aa  122  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  47.83 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  43.08 
 
 		 129 aa  113  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  43.08 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  46.15 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 		 133 aa  106  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  44.88 
 
 		 146 aa  104  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  38.46 
 
 		 130 aa  104  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  42.19 
 
 		 129 aa  103  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 128 aa  101  3e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  41.54 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  37.01 
 
 		 132 aa  100  8e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  39.84 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 129 aa  95.9  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  43.08 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  40.57 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  36.3 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  42.99 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  40.78 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  35.97 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  39.1 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  32.09 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  36.15 
 
 		 139 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  31.78 
 
 		 130 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  32.31 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  34.59 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  42.72 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  37.78 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 142 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  36.09 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  33.82 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  30.23 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  36.63 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  40.59 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  36.63 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  36.63 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  35.34 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  28.68 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  36.63 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  36.63 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  36.63 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  36.63 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  28.68 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.48 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  35.64 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  38.35 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  34.35 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 		 145 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  34.09 
 
 		 142 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  37.62 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  30 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  36.89 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  35.64 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  31.88 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  35.64 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3316  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2683  histidine triad (HIT) protein  38.82 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  35.58 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  32.33 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  31.34 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2451  histidine triad (HIT) protein  34.62 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  33.66 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  35.56 
 
 		 148 aa  67  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  36.63 
 
 		 139 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  38.26 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  31.58 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  32.09 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  32.04 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  30.53 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  35.94 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  30 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>