More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1970 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1970  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
146 aa  291  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.939838  hitchhiker  0.0000383714 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2413  histidine triad (HIT) protein  56.12 
 
 
148 aa  150  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0135198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2368  histidine triad (HIT) protein  50.74 
 
 
142 aa  148  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000014225 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2633  histidine triad (HIT) protein  50 
 
 
142 aa  143  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00206121  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4676  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0370318  normal  0.851631 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4971  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4588  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 
138 aa  135  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07820  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  53.64 
 
 
142 aa  134  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1583  histidine triad (HIT) protein  45.45 
 
 
134 aa  131  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5173  histidine triad (HIT) protein  48.09 
 
 
138 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.707443 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10774  hypothetical protein  46.51 
 
 
133 aa  128  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0826  histidine triad (HIT) protein  47.01 
 
 
141 aa  122  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15219  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1701  histidine triad (HIT) protein  46.43 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3629  histidine triad (HIT) protein  44.7 
 
 
133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3102  histidine triad (HIT) protein  44.88 
 
 
131 aa  104  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.550311  normal  0.852173 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1815  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 
136 aa  100  9e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0400003  normal  0.0526222 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2900  histidine triad (HIT) protein  38.58 
 
 
131 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.276504  normal  0.0712491 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3302  HIT family protein  38.58 
 
 
131 aa  89  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0732  hypothetical protein  30.28 
 
 
132 aa  85.1  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1632  HIT family protein  28.46 
 
 
130 aa  83.6  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0437202  hitchhiker  0.00568101 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  36 
 
 
129 aa  79.3  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0302  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3809  histidine triad (HIT) protein  28.79 
 
 
133 aa  78.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.197548  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1241  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
131 aa  76.6  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1591  histidine triad (HIT) protein  31 
 
 
129 aa  76.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1687  HIT family protein  35.51 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.833443 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2151  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.14674  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1055  histidine triad (HIT) protein  34.82 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4584  histidine triad (HIT) protein  33.94 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000842385  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2807  histidine triad (HIT) protein  34.88 
 
 
145 aa  68.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  29.32 
 
 
140 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  29.32 
 
 
140 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  32 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  30.83 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  28.03 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  31.11 
 
 
142 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  32.35 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4837  histidine triad (HIT) protein  31.06 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161096  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  35.19 
 
 
139 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  33.65 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  27.21 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2405  histidine triad (HIT) protein  27.74 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.112602  normal  0.457991 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2416  histidine triad (HIT) protein  30.66 
 
 
146 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0525465  normal  0.0378675 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  30.37 
 
 
142 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  31.16 
 
 
139 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4709  histidine triad (HIT) protein  30.84 
 
 
153 aa  60.8  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  34.65 
 
 
455 aa  60.8  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
143 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  27.35 
 
 
139 aa  60.5  0.000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  29.91 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3549  histidine triad (HIT) protein  29.13 
 
 
142 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.276085  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  31.68 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  29.17 
 
 
149 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1076  histidine triad (HIT) protein  29.52 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1829  putative HIT family protein  30.22 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3416  histidine triad  28.3 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.621229  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3351  histidine triad  28.3 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.814063 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3422  histidine triad  28.3 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0740  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.66623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3517  hypothetical protein  28.3 
 
 
151 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.810284  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  26.98 
 
 
136 aa  59.3  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0191  histidine triad (HIT) protein  34.55 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3536  histidine triad (HIT) protein  34.01 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.806394 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0268  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00140849  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  22.58 
 
 
131 aa  57.8  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  27.21 
 
 
143 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1302  histidine triad (HIT) protein  28.57 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0746  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3046  histidine triad (HIT) protein  30.1 
 
 
142 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.422459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1376  histidine triad (HIT) protein  28.43 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21440  putative HIT family protein  28.37 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.117632  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  30.77 
 
 
139 aa  57.4  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf126  HINT (histidine triad nucleotide-binding protein) family member  26.26 
 
 
107 aa  57.4  0.00000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0179  histidine triad (HIT) protein  37.86 
 
 
170 aa  57  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3136  histidine triad (HIT) protein  28.24 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.186474  normal  0.519956 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0211  histidine triad (HIT) protein  29.79 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  28.16 
 
 
141 aa  57  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2973  histidine triad (HIT) protein  32.11 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  27.68 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  31.73 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  27.68 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  27.21 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  31.48 
 
 
144 aa  56.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0832  histidine triad (HIT) protein  26.53 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  28.04 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  27.68 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  27.68 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  27.68 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  27.03 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0213  histidine triad (HIT) protein  29.47 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000319574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  27.68 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  26.73 
 
 
133 aa  55.1  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  34.02 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0472  HIT family protein  25 
 
 
131 aa  55.5  0.0000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.974422  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  28.95 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5446  histidine triad (HIT) protein  33.08 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.311796 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>