More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3349 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
148 aa  293  8e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  59.42 
 
 
148 aa  160  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  53.9 
 
 
141 aa  149  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  50.74 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  51.38 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1263  histidine triad (HIT) protein  36.43 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000437908  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  44.68 
 
 
143 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0381  protein kinase C1 inhibitor  43.64 
 
 
139 aa  107  8.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  46.04 
 
 
142 aa  103  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  35.88 
 
 
138 aa  103  7e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1891  histidine triad (HIT) protein  46.15 
 
 
137 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3451  histidine triad (HIT) protein  43.88 
 
 
149 aa  100  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.923698  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  38.3 
 
 
139 aa  100  6e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  48.62 
 
 
145 aa  100  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  41.27 
 
 
140 aa  100  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  38.46 
 
 
165 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  38.93 
 
 
144 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  99  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  39.23 
 
 
144 aa  99  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  98.6  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  38.46 
 
 
144 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  40.88 
 
 
149 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  49.51 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
143 aa  97.1  8e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  39.83 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  47.32 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  37.32 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  43.38 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  43.38 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  33.33 
 
 
131 aa  92.8  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  41.18 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  38.39 
 
 
132 aa  91.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  35.96 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  37.96 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1009  histidine triad (HIT) protein  44.44 
 
 
139 aa  91.3  5e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  40.85 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  47.22 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1228  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  37.61 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0892724  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  32.54 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 
130 aa  87.8  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  43.97 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 
130 aa  88.2  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  35.71 
 
 
139 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  44.12 
 
 
144 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  38.89 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3180  histidine triad (HIT) protein  38.58 
 
 
135 aa  84.7  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.45 
 
 
144 aa  85.1  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  36.17 
 
 
144 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  40.16 
 
 
145 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  41.61 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0229  histidine triad (HIT) protein  42.2 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.280449  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  36.43 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06270  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  36.69 
 
 
128 aa  82.8  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0484184  normal  0.0161272 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47340  putative HIT family protein  37.76 
 
 
153 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  41.38 
 
 
136 aa  82  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  38.69 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  33.33 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1275  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  35.19 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  33.33 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4085  putative HIT family protein  41.23 
 
 
153 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.531495  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3833  histidine triad (HIT) protein  45.87 
 
 
120 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  40.71 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  34.19 
 
 
135 aa  81.3  0.000000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3248  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
116 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00763147  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 
141 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4702  histidine triad (HIT) protein  37.68 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557305 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  38.41 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5451  histidine triad (HIT) protein  43.12 
 
 
115 aa  79.7  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  39.16 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  37.5 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0492  HIT family protein  41.03 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  36.96 
 
 
143 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0494  putative HIT-like protein  39.13 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  36.8 
 
 
136 aa  77.4  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3348  histidine triad  30.5 
 
 
157 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  34.31 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1891  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  33.94 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1925  histidine triad (HIT) protein  31.75 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2703  HIT family protein  40.17 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0207  HIT family protein  40.17 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  33.81 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1579  HIT family protein  40.17 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.380866  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0979  HIT family protein  40.17 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  29.71 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1382  HIT family protein  40.17 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  29.32 
 
 
136 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1292  histidine triad (HIT) protein  36.88 
 
 
145 aa  76.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268815  normal  0.885199 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2559  HIT family protein  40.17 
 
 
138 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.609142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>