More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0862 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0862  histidine triad (HIT) protein  100 
 
 
140 aa  280  5.000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.379989  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0919  histidine triad (HIT) protein  85.71 
 
 
140 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.420438  normal  0.191843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6333  histidine triad (HIT) protein  63.16 
 
 
142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303729  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3399  histidine triad (HIT) protein  60.74 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.163397  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1284  histidine triad (HIT) protein  64.44 
 
 
142 aa  169  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2135  histidine triad (HIT) protein  58.96 
 
 
148 aa  164  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.605825  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0141  histidine triad (HIT) protein  52.59 
 
 
144 aa  148  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4456  histidine triad (HIT) protein  46.88 
 
 
145 aa  103  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2239  histidine triad (HIT) protein  44.6 
 
 
145 aa  103  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.640796  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1050  histidine triad (HIT) protein  39.86 
 
 
139 aa  100  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.265499  normal  0.307581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2169  histidine triad (HIT) protein  39.26 
 
 
140 aa  99  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1740  histidine triad protein  37.04 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.458061 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1531  histidine triad (HIT) protein  37.38 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4028  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.800819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3954  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
143 aa  93.6  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1616  histidine triad (HIT) protein  38.97 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3968  histidine triad (HIT) protein  41.01 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.777319  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2237  histidine triad (HIT) protein  36.23 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3108  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 
143 aa  91.3  4e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2454  histidine triad (HIT) protein  41.48 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.832288  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11288  HIT family protein  42.06 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.750453  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3349  histidine triad (HIT) protein  48.21 
 
 
148 aa  87.4  5e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425203 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1993  histidine triad (HIT) protein  40.94 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2145  histidine triad (HIT) protein  38.24 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538577  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2539  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 
139 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.170824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2848  histidine triad (HIT) protein  37.76 
 
 
136 aa  85.5  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0096  histidine triad (HIT) protein  36 
 
 
139 aa  84.3  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1749  histidine triad (HIT) protein  39.81 
 
 
139 aa  82.4  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3726  histidine triad (HIT) protein  29.2 
 
 
138 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2280  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  36.21 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03708  HIT domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G12680)  31.16 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.117728  normal  0.7439 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2024  histidine triad (HIT) protein  37.23 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00190  hydrolase, putative  28.06 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1573  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolase  34.48 
 
 
139 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0644  histidine triad (HIT) protein  35.9 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0004  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0275782 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3642  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0807517  normal  0.0488836 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1376  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
151 aa  79.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.341423  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0781  histidine triad (HIT) protein  37.04 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1025  histidine triad (HIT) protein  29.1 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0579  histidine triad domain-containing protein  33.93 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0235717  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1561  histidine triad (HIT) protein  34.07 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1574  histidine triad (HIT) protein  33.81 
 
 
141 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.650242  normal  0.227098 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1664  histidine triad (HIT) protein  36.5 
 
 
145 aa  77  0.00000000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.147901  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1342  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1333  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
130 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0568524  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1783  histidine triad (HIT) protein  33.79 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.344857  normal  0.911997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1461  histidine triad (HIT) protein  37.61 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1771  histidine triad (HIT) protein  35.25 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123943  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2801  histidine triad (HIT) protein  31.39 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.106273  normal  0.788809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1342  histidine triad (HIT) protein  32.08 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0075  histidine triad (HIT) protein  39.25 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0370  HIT family protein  30.47 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0327  histidine triad (HIT) protein  40 
 
 
144 aa  75.5  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0007671  normal  0.0222978 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3327  histidine triad (HIT) protein  35.07 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.036152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6201  histidine triad (HIT) protein  38.69 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.488321  normal  0.398749 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0620  histidine triad (HIT) protein  34.58 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.693859  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4320  histidine triad (HIT) protein  36.03 
 
 
142 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862778  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4476  putative histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
141 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000626279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1125  HIT family protein  35.04 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.20711  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1614  histidine triad (HIT) protein  34.56 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1168  HIT family protein  35.04 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.247304  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3753  histidine triad (HIT) protein  34.78 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.052098 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3968  histidine triad (HIT) protein  35.51 
 
 
141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2534  HIT family protein  37.04 
 
 
141 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.91947  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42119  protein kinase C inhibitor-I, histidine triad nucleotide-binding protein-like protein  28.33 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.149088 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2290  histidine triad (HIT) protein  32.59 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.777464  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0006  histidine triad (HIT) protein  32.37 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0070148  unclonable  0.000000000279381 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2890  histidine triad (HIT) protein  31.88 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1076  histidine triad (HIT) protein  40.34 
 
 
114 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0075  histidine triad (HIT) protein  32.12 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  0.167835 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0978  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0966  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0957  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0254  histidine triad (HIT) protein  32.39 
 
 
145 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1212  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1047  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0596  histidine triad (HIT) protein  31.13 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1124  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1151  HIT family protein  33.04 
 
 
165 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0814  histidine triad (HIT) protein  31.86 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4827  histidine triad (HIT) protein  38.68 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.487703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1083  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4221  HIT family protein  33.04 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.071329  normal  0.0179678 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl245  putative nucleotidyl hydrolase/transferase  29.37 
 
 
135 aa  70.9  0.000000000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6595  histidine triad (HIT) protein  35.82 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01700  HIT family protein  25.37 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4689  histidine triad (HIT) protein  35.29 
 
 
142 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0956525  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2926  histidine triad (HIT) protein  32.84 
 
 
149 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0962  histidine triad (HIT) protein  33.04 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4498  histidine triad (HIT) protein  32.39 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1163  histidine triad (HIT) protein  35.9 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12220  HIT family hydrolase, diadenosine tetraphosphate hydrolase  35.92 
 
 
130 aa  68.9  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1805  histidine triad (HIT) protein  36.54 
 
 
141 aa  68.9  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.496797 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1444  diadenosine tetraphosphate (Ap4A) hydrolase and other HIT family hydrolases  29.55 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339612  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3878  histidine triad (HIT) protein  33.83 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000287053  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0711  histidine triad (HIT) protein  38.17 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0363676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0788  histidine triad (HIT) protein  31.82 
 
 
455 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.864692  normal  0.369294 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3185  histidine triad (HIT) protein  36.57 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4014  histidine triad (HIT) protein  32.58 
 
 
137 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>